Protein–RNA interactions for Protein: P14324

FDPS, Farnesyl pyrophosphate synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDPSP14324 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FDPSP14324 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
FDPSP14324 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
FDPSP14324 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FDPSP14324 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FDPSP14324 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
FDPSP14324 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FDPSP14324 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FDPSP14324 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
FDPSP14324 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
FDPSP14324 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
FDPSP14324 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
FDPSP14324 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
FDPSP14324 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FDPSP14324 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FDPSP14324 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FDPSP14324 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FDPSP14324 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FDPSP14324 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FDPSP14324 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FDPSP14324 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
FDPSP14324 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FDPSP14324 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
FDPSP14324 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
FDPSP14324 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
FDPSP14324 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
FDPSP14324 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FDPSP14324 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FDPSP14324 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FDPSP14324 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FDPSP14324 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
FDPSP14324 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
FDPSP14324 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
FDPSP14324 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
FDPSP14324 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
FDPSP14324 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FDPSP14324 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
FDPSP14324 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
FDPSP14324 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
FDPSP14324 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
FDPSP14324 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FDPSP14324 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
FDPSP14324 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
FDPSP14324 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FDPSP14324 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FDPSP14324 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
FDPSP14324 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
FDPSP14324 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FDPSP14324 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
FDPSP14324 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FDPSP14324 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
FDPSP14324 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
FDPSP14324 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FDPSP14324 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
FDPSP14324 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FDPSP14324 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FDPSP14324 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
FDPSP14324 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
FDPSP14324 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
FDPSP14324 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
FDPSP14324 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
FDPSP14324 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
FDPSP14324 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
FDPSP14324 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
FDPSP14324 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
FDPSP14324 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
FDPSP14324 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
FDPSP14324 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
FDPSP14324 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
FDPSP14324 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FDPSP14324 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
FDPSP14324 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FDPSP14324 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FDPSP14324 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FDPSP14324 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FDPSP14324 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FDPSP14324 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FDPSP14324 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
FDPSP14324 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
FDPSP14324 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
FDPSP14324 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
FDPSP14324 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FDPSP14324 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FDPSP14324 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FDPSP14324 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FDPSP14324 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FDPSP14324 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
FDPSP14324 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
FDPSP14324 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.16
FDPSP14324 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FDPSP14324 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FDPSP14324 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FDPSP14324 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
FDPSP14324 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
FDPSP14324 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
FDPSP14324 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
FDPSP14324 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
FDPSP14324 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FDPSP14324 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FDPSP14324 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms