Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GLI4P10075 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GLI4P10075 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GLI4P10075 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GLI4P10075 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GLI4P10075 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GLI4P10075 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GLI4P10075 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GLI4P10075 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GLI4P10075 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GLI4P10075 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GLI4P10075 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GLI4P10075 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GLI4P10075 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GLI4P10075 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GLI4P10075 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GLI4P10075 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GLI4P10075 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GLI4P10075 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GLI4P10075 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GLI4P10075 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GLI4P10075 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GLI4P10075 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GLI4P10075 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GLI4P10075 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GLI4P10075 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GLI4P10075 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GLI4P10075 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GLI4P10075 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GLI4P10075 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GLI4P10075 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GLI4P10075 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GLI4P10075 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GLI4P10075 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GLI4P10075 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GLI4P10075 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GLI4P10075 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GLI4P10075 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GLI4P10075 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GLI4P10075 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GLI4P10075 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GLI4P10075 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GLI4P10075 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GLI4P10075 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GLI4P10075 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GLI4P10075 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GLI4P10075 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GLI4P10075 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GLI4P10075 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GLI4P10075 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GLI4P10075 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GLI4P10075 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GLI4P10075 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GLI4P10075 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GLI4P10075 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GLI4P10075 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GLI4P10075 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GLI4P10075 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GLI4P10075 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GLI4P10075 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GLI4P10075 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GLI4P10075 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLI4P10075 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLI4P10075 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLI4P10075 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GLI4P10075 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GLI4P10075 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GLI4P10075 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GLI4P10075 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GLI4P10075 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GLI4P10075 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GLI4P10075 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GLI4P10075 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GLI4P10075 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GLI4P10075 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GLI4P10075 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GLI4P10075 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GLI4P10075 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GLI4P10075 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GLI4P10075 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GLI4P10075 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GLI4P10075 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GLI4P10075 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GLI4P10075 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GLI4P10075 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GLI4P10075 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GLI4P10075 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GLI4P10075 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GLI4P10075 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GLI4P10075 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GLI4P10075 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GLI4P10075 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GLI4P10075 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GLI4P10075 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GLI4P10075 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GLI4P10075 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GLI4P10075 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GLI4P10075 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GLI4P10075 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GLI4P10075 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms