Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
GLI3P10071 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
GLI3P10071 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
GLI3P10071 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
GLI3P10071 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
GLI3P10071 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
GLI3P10071 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
GLI3P10071 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC33.54■■■□□ 2.96
GLI3P10071 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
GLI3P10071 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
GLI3P10071 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
GLI3P10071 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
GLI3P10071 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
GLI3P10071 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
GLI3P10071 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
GLI3P10071 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
GLI3P10071 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
GLI3P10071 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.96
GLI3P10071 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
GLI3P10071 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC33.51■■■□□ 2.96
GLI3P10071 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
GLI3P10071 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
GLI3P10071 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
GLI3P10071 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC33.51■■■□□ 2.95
GLI3P10071 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
GLI3P10071 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
GLI3P10071 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
GLI3P10071 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
GLI3P10071 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
GLI3P10071 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
GLI3P10071 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
GLI3P10071 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
GLI3P10071 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
GLI3P10071 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
GLI3P10071 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
GLI3P10071 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
GLI3P10071 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
GLI3P10071 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
GLI3P10071 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
GLI3P10071 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
GLI3P10071 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
GLI3P10071 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
GLI3P10071 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
GLI3P10071 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
GLI3P10071 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
GLI3P10071 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
GLI3P10071 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
GLI3P10071 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
GLI3P10071 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
GLI3P10071 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC33.43■■■□□ 2.94
GLI3P10071 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC33.42■■■□□ 2.94
GLI3P10071 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
GLI3P10071 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
GLI3P10071 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
GLI3P10071 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
GLI3P10071 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
GLI3P10071 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
GLI3P10071 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
GLI3P10071 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
GLI3P10071 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
GLI3P10071 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
GLI3P10071 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
GLI3P10071 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
GLI3P10071 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
GLI3P10071 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
GLI3P10071 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
GLI3P10071 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
GLI3P10071 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
GLI3P10071 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
GLI3P10071 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC33.37■■■□□ 2.93
GLI3P10071 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
GLI3P10071 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
GLI3P10071 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
GLI3P10071 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
GLI3P10071 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
GLI3P10071 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
GLI3P10071 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
GLI3P10071 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
GLI3P10071 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC33.35■■■□□ 2.93
GLI3P10071 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
GLI3P10071 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
GLI3P10071 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
GLI3P10071 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
GLI3P10071 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
GLI3P10071 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
GLI3P10071 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
GLI3P10071 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
GLI3P10071 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
GLI3P10071 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
GLI3P10071 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
GLI3P10071 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
GLI3P10071 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
GLI3P10071 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
GLI3P10071 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
GLI3P10071 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
GLI3P10071 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
GLI3P10071 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
GLI3P10071 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC33.27■■■□□ 2.92
GLI3P10071 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
GLI3P10071 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms