Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAPPC2BP0DI82 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAPPC2BP0DI82 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAPPC2BP0DI82 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAPPC2BP0DI82 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAPPC2BP0DI82 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAPPC2BP0DI82 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAPPC2BP0DI82 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAPPC2BP0DI82 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAPPC2BP0DI82 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAPPC2BP0DI82 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAPPC2BP0DI82 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAPPC2BP0DI82 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAPPC2BP0DI82 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAPPC2BP0DI82 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAPPC2BP0DI82 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAPPC2BP0DI82 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAPPC2BP0DI82 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAPPC2BP0DI82 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAPPC2BP0DI82 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAPPC2BP0DI82 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAPPC2BP0DI82 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAPPC2BP0DI82 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.99
TRAPPC2BP0DI82 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
TRAPPC2BP0DI82 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAPPC2BP0DI82 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAPPC2BP0DI82 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAPPC2BP0DI82 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAPPC2BP0DI82 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAPPC2BP0DI82 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAPPC2BP0DI82 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAPPC2BP0DI82 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAPPC2BP0DI82 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAPPC2BP0DI82 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAPPC2BP0DI82 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAPPC2BP0DI82 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAPPC2BP0DI82 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAPPC2BP0DI82 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAPPC2BP0DI82 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAPPC2BP0DI82 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAPPC2BP0DI82 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAPPC2BP0DI82 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAPPC2BP0DI82 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAPPC2BP0DI82 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAPPC2BP0DI82 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAPPC2BP0DI82 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAPPC2BP0DI82 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAPPC2BP0DI82 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAPPC2BP0DI82 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAPPC2BP0DI82 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAPPC2BP0DI82 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAPPC2BP0DI82 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAPPC2BP0DI82 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAPPC2BP0DI82 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAPPC2BP0DI82 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAPPC2BP0DI82 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAPPC2BP0DI82 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAPPC2BP0DI82 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAPPC2BP0DI82 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRAPPC2BP0DI82 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRAPPC2BP0DI82 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRAPPC2BP0DI82 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAPPC2BP0DI82 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAPPC2BP0DI82 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAPPC2BP0DI82 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAPPC2BP0DI82 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAPPC2BP0DI82 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAPPC2BP0DI82 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAPPC2BP0DI82 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAPPC2BP0DI82 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAPPC2BP0DI82 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAPPC2BP0DI82 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAPPC2BP0DI82 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAPPC2BP0DI82 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAPPC2BP0DI82 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAPPC2BP0DI82 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAPPC2BP0DI82 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAPPC2BP0DI82 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAPPC2BP0DI82 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAPPC2BP0DI82 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAPPC2BP0DI82 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAPPC2BP0DI82 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAPPC2BP0DI82 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAPPC2BP0DI82 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAPPC2BP0DI82 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAPPC2BP0DI82 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAPPC2BP0DI82 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAPPC2BP0DI82 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAPPC2BP0DI82 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAPPC2BP0DI82 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAPPC2BP0DI82 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAPPC2BP0DI82 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAPPC2BP0DI82 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAPPC2BP0DI82 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC2BP0DI82 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC2BP0DI82 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC2BP0DI82 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC2BP0DI82 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC2BP0DI82 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC2BP0DI82 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.7 ms