Protein–RNA interactions for Protein: P0CW71

HSMCR30, Putative metaphase chromosome protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSMCR30P0CW71 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HSMCR30P0CW71 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HSMCR30P0CW71 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HSMCR30P0CW71 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HSMCR30P0CW71 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HSMCR30P0CW71 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
HSMCR30P0CW71 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
HSMCR30P0CW71 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
HSMCR30P0CW71 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
HSMCR30P0CW71 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HSMCR30P0CW71 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HSMCR30P0CW71 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HSMCR30P0CW71 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HSMCR30P0CW71 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HSMCR30P0CW71 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HSMCR30P0CW71 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HSMCR30P0CW71 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HSMCR30P0CW71 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HSMCR30P0CW71 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HSMCR30P0CW71 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HSMCR30P0CW71 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HSMCR30P0CW71 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HSMCR30P0CW71 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HSMCR30P0CW71 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HSMCR30P0CW71 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HSMCR30P0CW71 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HSMCR30P0CW71 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HSMCR30P0CW71 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HSMCR30P0CW71 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HSMCR30P0CW71 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HSMCR30P0CW71 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HSMCR30P0CW71 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HSMCR30P0CW71 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HSMCR30P0CW71 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HSMCR30P0CW71 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HSMCR30P0CW71 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HSMCR30P0CW71 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HSMCR30P0CW71 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HSMCR30P0CW71 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HSMCR30P0CW71 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HSMCR30P0CW71 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HSMCR30P0CW71 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HSMCR30P0CW71 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HSMCR30P0CW71 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HSMCR30P0CW71 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HSMCR30P0CW71 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HSMCR30P0CW71 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HSMCR30P0CW71 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HSMCR30P0CW71 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HSMCR30P0CW71 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HSMCR30P0CW71 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HSMCR30P0CW71 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HSMCR30P0CW71 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HSMCR30P0CW71 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HSMCR30P0CW71 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HSMCR30P0CW71 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HSMCR30P0CW71 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HSMCR30P0CW71 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HSMCR30P0CW71 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HSMCR30P0CW71 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HSMCR30P0CW71 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HSMCR30P0CW71 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HSMCR30P0CW71 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HSMCR30P0CW71 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HSMCR30P0CW71 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HSMCR30P0CW71 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HSMCR30P0CW71 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HSMCR30P0CW71 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HSMCR30P0CW71 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HSMCR30P0CW71 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HSMCR30P0CW71 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HSMCR30P0CW71 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HSMCR30P0CW71 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HSMCR30P0CW71 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HSMCR30P0CW71 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HSMCR30P0CW71 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HSMCR30P0CW71 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HSMCR30P0CW71 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HSMCR30P0CW71 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HSMCR30P0CW71 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HSMCR30P0CW71 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HSMCR30P0CW71 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HSMCR30P0CW71 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HSMCR30P0CW71 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HSMCR30P0CW71 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HSMCR30P0CW71 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HSMCR30P0CW71 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HSMCR30P0CW71 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HSMCR30P0CW71 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HSMCR30P0CW71 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HSMCR30P0CW71 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HSMCR30P0CW71 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HSMCR30P0CW71 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HSMCR30P0CW71 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HSMCR30P0CW71 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HSMCR30P0CW71 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HSMCR30P0CW71 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HSMCR30P0CW71 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HSMCR30P0CW71 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HSMCR30P0CW71 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms