Protein–RNA interactions for Protein: P08648

ITGA5, Integrin alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA5P08648 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGA5P08648 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGA5P08648 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGA5P08648 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGA5P08648 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGA5P08648 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGA5P08648 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA5P08648 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA5P08648 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA5P08648 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA5P08648 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA5P08648 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA5P08648 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA5P08648 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA5P08648 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA5P08648 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA5P08648 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA5P08648 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA5P08648 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA5P08648 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA5P08648 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA5P08648 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA5P08648 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA5P08648 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA5P08648 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA5P08648 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA5P08648 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA5P08648 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA5P08648 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA5P08648 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA5P08648 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGA5P08648 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGA5P08648 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGA5P08648 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGA5P08648 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGA5P08648 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGA5P08648 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGA5P08648 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGA5P08648 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGA5P08648 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGA5P08648 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGA5P08648 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGA5P08648 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGA5P08648 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGA5P08648 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGA5P08648 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGA5P08648 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ITGA5P08648 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA5P08648 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA5P08648 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA5P08648 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA5P08648 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA5P08648 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA5P08648 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA5P08648 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA5P08648 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA5P08648 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGA5P08648 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGA5P08648 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGA5P08648 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGA5P08648 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGA5P08648 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGA5P08648 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGA5P08648 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGA5P08648 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGA5P08648 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA5P08648 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA5P08648 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA5P08648 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA5P08648 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA5P08648 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA5P08648 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA5P08648 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGA5P08648 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGA5P08648 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGA5P08648 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGA5P08648 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGA5P08648 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGA5P08648 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGA5P08648 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGA5P08648 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGA5P08648 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGA5P08648 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGA5P08648 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ITGA5P08648 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITGA5P08648 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ITGA5P08648 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ITGA5P08648 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ITGA5P08648 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ITGA5P08648 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITGA5P08648 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITGA5P08648 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITGA5P08648 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA5P08648 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA5P08648 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA5P08648 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA5P08648 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA5P08648 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA5P08648 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA5P08648 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms