Protein–RNA interactions for Protein: P06753

TPM3, Tropomyosin alpha-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM3P06753 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TPM3P06753 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TPM3P06753 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TPM3P06753 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TPM3P06753 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
TPM3P06753 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TPM3P06753 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TPM3P06753 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TPM3P06753 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TPM3P06753 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.53■■■□□ 2
TPM3P06753 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TPM3P06753 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TPM3P06753 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TPM3P06753 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TPM3P06753 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TPM3P06753 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TPM3P06753 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TPM3P06753 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TPM3P06753 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
TPM3P06753 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TPM3P06753 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TPM3P06753 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TPM3P06753 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
TPM3P06753 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TPM3P06753 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TPM3P06753 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TPM3P06753 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TPM3P06753 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TPM3P06753 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TPM3P06753 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TPM3P06753 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TPM3P06753 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TPM3P06753 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TPM3P06753 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TPM3P06753 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TPM3P06753 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TPM3P06753 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TPM3P06753 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TPM3P06753 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TPM3P06753 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TPM3P06753 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TPM3P06753 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TPM3P06753 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TPM3P06753 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TPM3P06753 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TPM3P06753 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TPM3P06753 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TPM3P06753 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TPM3P06753 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TPM3P06753 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TPM3P06753 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TPM3P06753 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TPM3P06753 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TPM3P06753 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TPM3P06753 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TPM3P06753 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TPM3P06753 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TPM3P06753 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
TPM3P06753 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TPM3P06753 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TPM3P06753 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
TPM3P06753 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TPM3P06753 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TPM3P06753 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TPM3P06753 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TPM3P06753 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TPM3P06753 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TPM3P06753 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TPM3P06753 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TPM3P06753 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TPM3P06753 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TPM3P06753 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TPM3P06753 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
TPM3P06753 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TPM3P06753 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TPM3P06753 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TPM3P06753 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TPM3P06753 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TPM3P06753 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TPM3P06753 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TPM3P06753 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TPM3P06753 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TPM3P06753 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TPM3P06753 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TPM3P06753 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TPM3P06753 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TPM3P06753 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TPM3P06753 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TPM3P06753 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TPM3P06753 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TPM3P06753 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TPM3P06753 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TPM3P06753 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TPM3P06753 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TPM3P06753 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TPM3P06753 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TPM3P06753 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TPM3P06753 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TPM3P06753 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TPM3P06753 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms