Protein–RNA interactions for Protein: P04433

IGKV3-11, Immunoglobulin kappa variable 3-11, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV3-11P04433 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
IGKV3-11P04433 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IGKV3-11P04433 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IGKV3-11P04433 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
IGKV3-11P04433 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGKV3-11P04433 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGKV3-11P04433 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IGKV3-11P04433 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IGKV3-11P04433 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IGKV3-11P04433 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IGKV3-11P04433 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IGKV3-11P04433 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IGKV3-11P04433 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IGKV3-11P04433 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IGKV3-11P04433 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IGKV3-11P04433 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IGKV3-11P04433 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
IGKV3-11P04433 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IGKV3-11P04433 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
IGKV3-11P04433 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
IGKV3-11P04433 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
IGKV3-11P04433 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IGKV3-11P04433 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
IGKV3-11P04433 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IGKV3-11P04433 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IGKV3-11P04433 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IGKV3-11P04433 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IGKV3-11P04433 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IGKV3-11P04433 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IGKV3-11P04433 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
IGKV3-11P04433 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IGKV3-11P04433 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IGKV3-11P04433 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IGKV3-11P04433 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IGKV3-11P04433 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IGKV3-11P04433 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IGKV3-11P04433 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
IGKV3-11P04433 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IGKV3-11P04433 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IGKV3-11P04433 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IGKV3-11P04433 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IGKV3-11P04433 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IGKV3-11P04433 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IGKV3-11P04433 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGKV3-11P04433 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGKV3-11P04433 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGKV3-11P04433 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGKV3-11P04433 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGKV3-11P04433 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGKV3-11P04433 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGKV3-11P04433 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGKV3-11P04433 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGKV3-11P04433 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGKV3-11P04433 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
IGKV3-11P04433 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGKV3-11P04433 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGKV3-11P04433 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGKV3-11P04433 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGKV3-11P04433 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGKV3-11P04433 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
IGKV3-11P04433 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGKV3-11P04433 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGKV3-11P04433 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IGKV3-11P04433 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IGKV3-11P04433 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IGKV3-11P04433 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IGKV3-11P04433 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
IGKV3-11P04433 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IGKV3-11P04433 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IGKV3-11P04433 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IGKV3-11P04433 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IGKV3-11P04433 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IGKV3-11P04433 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IGKV3-11P04433 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IGKV3-11P04433 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IGKV3-11P04433 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IGKV3-11P04433 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IGKV3-11P04433 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IGKV3-11P04433 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IGKV3-11P04433 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IGKV3-11P04433 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IGKV3-11P04433 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IGKV3-11P04433 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
IGKV3-11P04433 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IGKV3-11P04433 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
IGKV3-11P04433 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IGKV3-11P04433 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IGKV3-11P04433 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IGKV3-11P04433 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGKV3-11P04433 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGKV3-11P04433 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGKV3-11P04433 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGKV3-11P04433 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGKV3-11P04433 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGKV3-11P04433 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGKV3-11P04433 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGKV3-11P04433 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGKV3-11P04433 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
IGKV3-11P04433 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IGKV3-11P04433 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms