Protein–RNA interactions for Protein: P04196

HRG, Histidine-rich glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRGP04196 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HRGP04196 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HRGP04196 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HRGP04196 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HRGP04196 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HRGP04196 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HRGP04196 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HRGP04196 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HRGP04196 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HRGP04196 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HRGP04196 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HRGP04196 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HRGP04196 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HRGP04196 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HRGP04196 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HRGP04196 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HRGP04196 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HRGP04196 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HRGP04196 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HRGP04196 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HRGP04196 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HRGP04196 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HRGP04196 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HRGP04196 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HRGP04196 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HRGP04196 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HRGP04196 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HRGP04196 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HRGP04196 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HRGP04196 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HRGP04196 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HRGP04196 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HRGP04196 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HRGP04196 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HRGP04196 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HRGP04196 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HRGP04196 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
HRGP04196 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HRGP04196 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HRGP04196 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HRGP04196 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HRGP04196 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HRGP04196 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HRGP04196 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HRGP04196 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HRGP04196 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HRGP04196 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HRGP04196 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HRGP04196 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HRGP04196 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HRGP04196 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HRGP04196 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HRGP04196 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HRGP04196 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HRGP04196 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HRGP04196 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HRGP04196 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HRGP04196 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HRGP04196 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HRGP04196 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HRGP04196 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HRGP04196 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HRGP04196 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HRGP04196 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HRGP04196 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HRGP04196 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HRGP04196 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HRGP04196 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HRGP04196 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HRGP04196 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HRGP04196 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HRGP04196 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HRGP04196 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HRGP04196 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HRGP04196 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HRGP04196 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HRGP04196 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HRGP04196 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HRGP04196 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HRGP04196 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HRGP04196 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HRGP04196 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HRGP04196 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HRGP04196 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HRGP04196 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HRGP04196 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HRGP04196 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HRGP04196 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HRGP04196 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HRGP04196 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HRGP04196 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HRGP04196 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HRGP04196 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HRGP04196 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HRGP04196 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HRGP04196 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HRGP04196 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HRGP04196 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HRGP04196 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HRGP04196 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms