Protein–RNA interactions for Protein: O95255

ABCC6, Multidrug resistance-associated protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC6O95255 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
ABCC6O95255 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
ABCC6O95255 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
ABCC6O95255 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
ABCC6O95255 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
ABCC6O95255 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
ABCC6O95255 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
ABCC6O95255 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
ABCC6O95255 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
ABCC6O95255 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
ABCC6O95255 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
ABCC6O95255 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
ABCC6O95255 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.93
ABCC6O95255 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
ABCC6O95255 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
ABCC6O95255 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
ABCC6O95255 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
ABCC6O95255 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
ABCC6O95255 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
ABCC6O95255 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
ABCC6O95255 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
ABCC6O95255 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
ABCC6O95255 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
ABCC6O95255 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
ABCC6O95255 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
ABCC6O95255 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
ABCC6O95255 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
ABCC6O95255 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
ABCC6O95255 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
ABCC6O95255 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
ABCC6O95255 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
ABCC6O95255 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC33.26■■■□□ 2.92
ABCC6O95255 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
ABCC6O95255 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
ABCC6O95255 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
ABCC6O95255 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
ABCC6O95255 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
ABCC6O95255 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
ABCC6O95255 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ABCC6O95255 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
ABCC6O95255 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ABCC6O95255 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ABCC6O95255 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
ABCC6O95255 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
ABCC6O95255 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
ABCC6O95255 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
ABCC6O95255 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
ABCC6O95255 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC33.24■■■□□ 2.91
ABCC6O95255 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
ABCC6O95255 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC33.23■■■□□ 2.91
ABCC6O95255 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
ABCC6O95255 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
ABCC6O95255 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
ABCC6O95255 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
ABCC6O95255 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC33.23■■■□□ 2.91
ABCC6O95255 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
ABCC6O95255 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
ABCC6O95255 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
ABCC6O95255 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
ABCC6O95255 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
ABCC6O95255 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
ABCC6O95255 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
ABCC6O95255 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
ABCC6O95255 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
ABCC6O95255 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
ABCC6O95255 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
ABCC6O95255 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
ABCC6O95255 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
ABCC6O95255 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
ABCC6O95255 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
ABCC6O95255 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
ABCC6O95255 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
ABCC6O95255 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
ABCC6O95255 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
ABCC6O95255 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
ABCC6O95255 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
ABCC6O95255 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
ABCC6O95255 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
ABCC6O95255 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
ABCC6O95255 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
ABCC6O95255 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
ABCC6O95255 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
ABCC6O95255 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
ABCC6O95255 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
ABCC6O95255 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
ABCC6O95255 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
ABCC6O95255 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
ABCC6O95255 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
ABCC6O95255 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
ABCC6O95255 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC33.13■■■□□ 2.89
ABCC6O95255 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
ABCC6O95255 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
ABCC6O95255 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
ABCC6O95255 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
ABCC6O95255 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
ABCC6O95255 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
ABCC6O95255 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
ABCC6O95255 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
ABCC6O95255 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
ABCC6O95255 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms