Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC40■■■■□ 3.99
KIAA0556O60303 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
KIAA0556O60303 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC39.99■■■■□ 3.99
KIAA0556O60303 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
KIAA0556O60303 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC39.99■■■■□ 3.99
KIAA0556O60303 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC39.98■■■■□ 3.99
KIAA0556O60303 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.98■■■■□ 3.99
KIAA0556O60303 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
KIAA0556O60303 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.98■■■■□ 3.99
KIAA0556O60303 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
KIAA0556O60303 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC39.98■■■■□ 3.99
KIAA0556O60303 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.98■■■■□ 3.99
KIAA0556O60303 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
KIAA0556O60303 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
KIAA0556O60303 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC39.97■■■■□ 3.99
KIAA0556O60303 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC39.97■■■■□ 3.99
KIAA0556O60303 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
KIAA0556O60303 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
KIAA0556O60303 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC39.95■■■■□ 3.99
KIAA0556O60303 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
KIAA0556O60303 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
KIAA0556O60303 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC39.95■■■■□ 3.99
KIAA0556O60303 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC39.95■■■■□ 3.99
KIAA0556O60303 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC39.94■■■■□ 3.99
KIAA0556O60303 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.99
KIAA0556O60303 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC39.94■■■■□ 3.99
KIAA0556O60303 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC39.94■■■■□ 3.99
KIAA0556O60303 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
KIAA0556O60303 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
KIAA0556O60303 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.92■■■■□ 3.98
KIAA0556O60303 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
KIAA0556O60303 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
KIAA0556O60303 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC39.91■■■■□ 3.98
KIAA0556O60303 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
KIAA0556O60303 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC39.9■■■■□ 3.98
KIAA0556O60303 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.9■■■■□ 3.98
KIAA0556O60303 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
KIAA0556O60303 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
KIAA0556O60303 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.89■■■■□ 3.98
KIAA0556O60303 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC39.89■■■■□ 3.98
KIAA0556O60303 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
KIAA0556O60303 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.89■■■■□ 3.98
KIAA0556O60303 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
KIAA0556O60303 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
KIAA0556O60303 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
KIAA0556O60303 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.88■■■■□ 3.97
KIAA0556O60303 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
KIAA0556O60303 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
KIAA0556O60303 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
KIAA0556O60303 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC39.87■■■■□ 3.97
KIAA0556O60303 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC39.86■■■■□ 3.97
KIAA0556O60303 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC39.86■■■■□ 3.97
KIAA0556O60303 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC39.86■■■■□ 3.97
KIAA0556O60303 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC39.86■■■■□ 3.97
KIAA0556O60303 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
KIAA0556O60303 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC39.84■■■■□ 3.97
KIAA0556O60303 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC39.84■■■■□ 3.97
KIAA0556O60303 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC39.83■■■■□ 3.97
KIAA0556O60303 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
KIAA0556O60303 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC39.83■■■■□ 3.97
KIAA0556O60303 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC39.83■■■■□ 3.97
KIAA0556O60303 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC39.82■■■■□ 3.96
KIAA0556O60303 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.96
KIAA0556O60303 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.96
KIAA0556O60303 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC39.81■■■■□ 3.96
KIAA0556O60303 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC39.81■■■■□ 3.96
KIAA0556O60303 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC39.81■■■■□ 3.96
KIAA0556O60303 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC39.81■■■■□ 3.96
KIAA0556O60303 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC39.8■■■■□ 3.96
KIAA0556O60303 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC39.8■■■■□ 3.96
KIAA0556O60303 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC39.8■■■■□ 3.96
KIAA0556O60303 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.79■■■■□ 3.96
KIAA0556O60303 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC39.78■■■■□ 3.96
KIAA0556O60303 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
KIAA0556O60303 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC39.77■■■■□ 3.96
KIAA0556O60303 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC39.77■■■■□ 3.96
KIAA0556O60303 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC39.76■■■■□ 3.96
KIAA0556O60303 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC39.76■■■■□ 3.96
KIAA0556O60303 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
KIAA0556O60303 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC39.76■■■■□ 3.95
KIAA0556O60303 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC39.76■■■■□ 3.95
KIAA0556O60303 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC39.76■■■■□ 3.95
KIAA0556O60303 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC39.75■■■■□ 3.95
KIAA0556O60303 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
KIAA0556O60303 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
KIAA0556O60303 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.73■■■■□ 3.95
KIAA0556O60303 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
KIAA0556O60303 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
KIAA0556O60303 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.73■■■■□ 3.95
KIAA0556O60303 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
KIAA0556O60303 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.72■■■■□ 3.95
KIAA0556O60303 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.72■■■■□ 3.95
KIAA0556O60303 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC39.71■■■■□ 3.95
KIAA0556O60303 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
KIAA0556O60303 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
KIAA0556O60303 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC39.69■■■■□ 3.94
KIAA0556O60303 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
KIAA0556O60303 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
KIAA0556O60303 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
KIAA0556O60303 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86 ms