Protein–RNA interactions for Protein: O43617

TRAPPC3, Trafficking protein particle complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3O43617 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAPPC3O43617 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAPPC3O43617 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAPPC3O43617 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAPPC3O43617 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAPPC3O43617 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAPPC3O43617 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAPPC3O43617 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAPPC3O43617 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRAPPC3O43617 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRAPPC3O43617 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRAPPC3O43617 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRAPPC3O43617 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRAPPC3O43617 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TRAPPC3O43617 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRAPPC3O43617 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRAPPC3O43617 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRAPPC3O43617 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRAPPC3O43617 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRAPPC3O43617 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRAPPC3O43617 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRAPPC3O43617 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRAPPC3O43617 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TRAPPC3O43617 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TRAPPC3O43617 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRAPPC3O43617 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRAPPC3O43617 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRAPPC3O43617 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TRAPPC3O43617 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRAPPC3O43617 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRAPPC3O43617 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRAPPC3O43617 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRAPPC3O43617 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRAPPC3O43617 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRAPPC3O43617 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRAPPC3O43617 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRAPPC3O43617 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRAPPC3O43617 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRAPPC3O43617 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRAPPC3O43617 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRAPPC3O43617 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRAPPC3O43617 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRAPPC3O43617 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRAPPC3O43617 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRAPPC3O43617 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRAPPC3O43617 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
TRAPPC3O43617 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRAPPC3O43617 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRAPPC3O43617 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
TRAPPC3O43617 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRAPPC3O43617 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRAPPC3O43617 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRAPPC3O43617 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRAPPC3O43617 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRAPPC3O43617 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRAPPC3O43617 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRAPPC3O43617 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRAPPC3O43617 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRAPPC3O43617 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
TRAPPC3O43617 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRAPPC3O43617 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRAPPC3O43617 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRAPPC3O43617 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRAPPC3O43617 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRAPPC3O43617 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRAPPC3O43617 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRAPPC3O43617 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRAPPC3O43617 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRAPPC3O43617 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRAPPC3O43617 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
TRAPPC3O43617 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRAPPC3O43617 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRAPPC3O43617 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRAPPC3O43617 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRAPPC3O43617 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRAPPC3O43617 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TRAPPC3O43617 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRAPPC3O43617 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRAPPC3O43617 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRAPPC3O43617 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRAPPC3O43617 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRAPPC3O43617 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRAPPC3O43617 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRAPPC3O43617 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRAPPC3O43617 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRAPPC3O43617 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRAPPC3O43617 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRAPPC3O43617 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRAPPC3O43617 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRAPPC3O43617 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAPPC3O43617 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAPPC3O43617 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAPPC3O43617 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAPPC3O43617 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAPPC3O43617 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAPPC3O43617 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRAPPC3O43617 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRAPPC3O43617 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRAPPC3O43617 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRAPPC3O43617 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms