Protein–RNA interactions for Protein: O43173

ST8SIA3, Sia-alpha-2,3-Gal-beta-1,4-GlcNAc-R:alpha 2,8-sialyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ST8SIA3O43173 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ST8SIA3O43173 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ST8SIA3O43173 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ST8SIA3O43173 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ST8SIA3O43173 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ST8SIA3O43173 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ST8SIA3O43173 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ST8SIA3O43173 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ST8SIA3O43173 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ST8SIA3O43173 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ST8SIA3O43173 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ST8SIA3O43173 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ST8SIA3O43173 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ST8SIA3O43173 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ST8SIA3O43173 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ST8SIA3O43173 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ST8SIA3O43173 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ST8SIA3O43173 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ST8SIA3O43173 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ST8SIA3O43173 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ST8SIA3O43173 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ST8SIA3O43173 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ST8SIA3O43173 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ST8SIA3O43173 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ST8SIA3O43173 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ST8SIA3O43173 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ST8SIA3O43173 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ST8SIA3O43173 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ST8SIA3O43173 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ST8SIA3O43173 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ST8SIA3O43173 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ST8SIA3O43173 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ST8SIA3O43173 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ST8SIA3O43173 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ST8SIA3O43173 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ST8SIA3O43173 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ST8SIA3O43173 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ST8SIA3O43173 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ST8SIA3O43173 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ST8SIA3O43173 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ST8SIA3O43173 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ST8SIA3O43173 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ST8SIA3O43173 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ST8SIA3O43173 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ST8SIA3O43173 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ST8SIA3O43173 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ST8SIA3O43173 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ST8SIA3O43173 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ST8SIA3O43173 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ST8SIA3O43173 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ST8SIA3O43173 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ST8SIA3O43173 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ST8SIA3O43173 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ST8SIA3O43173 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ST8SIA3O43173 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ST8SIA3O43173 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ST8SIA3O43173 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ST8SIA3O43173 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ST8SIA3O43173 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ST8SIA3O43173 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ST8SIA3O43173 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ST8SIA3O43173 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ST8SIA3O43173 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ST8SIA3O43173 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ST8SIA3O43173 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ST8SIA3O43173 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ST8SIA3O43173 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ST8SIA3O43173 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ST8SIA3O43173 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ST8SIA3O43173 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ST8SIA3O43173 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ST8SIA3O43173 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ST8SIA3O43173 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ST8SIA3O43173 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ST8SIA3O43173 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ST8SIA3O43173 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ST8SIA3O43173 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ST8SIA3O43173 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ST8SIA3O43173 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ST8SIA3O43173 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ST8SIA3O43173 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ST8SIA3O43173 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ST8SIA3O43173 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ST8SIA3O43173 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ST8SIA3O43173 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ST8SIA3O43173 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ST8SIA3O43173 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ST8SIA3O43173 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ST8SIA3O43173 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ST8SIA3O43173 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ST8SIA3O43173 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ST8SIA3O43173 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ST8SIA3O43173 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ST8SIA3O43173 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ST8SIA3O43173 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ST8SIA3O43173 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ST8SIA3O43173 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ST8SIA3O43173 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ST8SIA3O43173 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ST8SIA3O43173 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms