Protein–RNA interactions for Protein: O14618

CCS, Copper chaperone for superoxide dismutase, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSO14618 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CCSO14618 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCSO14618 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCSO14618 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCSO14618 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCSO14618 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCSO14618 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCSO14618 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCSO14618 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCSO14618 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCSO14618 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCSO14618 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCSO14618 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCSO14618 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCSO14618 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCSO14618 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCSO14618 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCSO14618 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCSO14618 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCSO14618 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCSO14618 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCSO14618 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCSO14618 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCSO14618 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCSO14618 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCSO14618 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCSO14618 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCSO14618 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCSO14618 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCSO14618 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCSO14618 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCSO14618 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCSO14618 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCSO14618 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCSO14618 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCSO14618 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCSO14618 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCSO14618 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCSO14618 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCSO14618 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCSO14618 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCSO14618 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCSO14618 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCSO14618 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCSO14618 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCSO14618 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCSO14618 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCSO14618 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCSO14618 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCSO14618 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCSO14618 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCSO14618 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCSO14618 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCSO14618 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CCSO14618 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCSO14618 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCSO14618 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCSO14618 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCSO14618 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCSO14618 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCSO14618 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCSO14618 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCSO14618 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCSO14618 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCSO14618 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCSO14618 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCSO14618 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCSO14618 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCSO14618 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCSO14618 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCSO14618 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCSO14618 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCSO14618 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCSO14618 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCSO14618 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCSO14618 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCSO14618 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCSO14618 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCSO14618 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCSO14618 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCSO14618 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCSO14618 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCSO14618 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCSO14618 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCSO14618 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCSO14618 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCSO14618 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCSO14618 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCSO14618 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCSO14618 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCSO14618 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCSO14618 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CCSO14618 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCSO14618 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCSO14618 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCSO14618 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCSO14618 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCSO14618 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCSO14618 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCSO14618 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms