Protein–RNA interactions for Protein: A6NGJ6

TRIM64, Tripartite motif-containing protein 64, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM64A6NGJ6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM64A6NGJ6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM64A6NGJ6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM64A6NGJ6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM64A6NGJ6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM64A6NGJ6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM64A6NGJ6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM64A6NGJ6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM64A6NGJ6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM64A6NGJ6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM64A6NGJ6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM64A6NGJ6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM64A6NGJ6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM64A6NGJ6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM64A6NGJ6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM64A6NGJ6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM64A6NGJ6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM64A6NGJ6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM64A6NGJ6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM64A6NGJ6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM64A6NGJ6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM64A6NGJ6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM64A6NGJ6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM64A6NGJ6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM64A6NGJ6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM64A6NGJ6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM64A6NGJ6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM64A6NGJ6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM64A6NGJ6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM64A6NGJ6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM64A6NGJ6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM64A6NGJ6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM64A6NGJ6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM64A6NGJ6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM64A6NGJ6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM64A6NGJ6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM64A6NGJ6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM64A6NGJ6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM64A6NGJ6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM64A6NGJ6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM64A6NGJ6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM64A6NGJ6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM64A6NGJ6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM64A6NGJ6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM64A6NGJ6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM64A6NGJ6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM64A6NGJ6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM64A6NGJ6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM64A6NGJ6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM64A6NGJ6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM64A6NGJ6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM64A6NGJ6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM64A6NGJ6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM64A6NGJ6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM64A6NGJ6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM64A6NGJ6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM64A6NGJ6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM64A6NGJ6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM64A6NGJ6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM64A6NGJ6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM64A6NGJ6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM64A6NGJ6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM64A6NGJ6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM64A6NGJ6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM64A6NGJ6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM64A6NGJ6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM64A6NGJ6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM64A6NGJ6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM64A6NGJ6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM64A6NGJ6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM64A6NGJ6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM64A6NGJ6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM64A6NGJ6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRIM64A6NGJ6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRIM64A6NGJ6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM64A6NGJ6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM64A6NGJ6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM64A6NGJ6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM64A6NGJ6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM64A6NGJ6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM64A6NGJ6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM64A6NGJ6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM64A6NGJ6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM64A6NGJ6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM64A6NGJ6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM64A6NGJ6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM64A6NGJ6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM64A6NGJ6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM64A6NGJ6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM64A6NGJ6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM64A6NGJ6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM64A6NGJ6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM64A6NGJ6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM64A6NGJ6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM64A6NGJ6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM64A6NGJ6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM64A6NGJ6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM64A6NGJ6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM64A6NGJ6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM64A6NGJ6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms