Protein–RNA interactions for Protein: A6NGB9

WIPF3, WAS/WASL-interacting protein family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WIPF3A6NGB9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
WIPF3A6NGB9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
WIPF3A6NGB9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
WIPF3A6NGB9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
WIPF3A6NGB9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
WIPF3A6NGB9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
WIPF3A6NGB9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
WIPF3A6NGB9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
WIPF3A6NGB9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
WIPF3A6NGB9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
WIPF3A6NGB9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
WIPF3A6NGB9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
WIPF3A6NGB9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
WIPF3A6NGB9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
WIPF3A6NGB9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
WIPF3A6NGB9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
WIPF3A6NGB9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
WIPF3A6NGB9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
WIPF3A6NGB9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
WIPF3A6NGB9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
WIPF3A6NGB9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
WIPF3A6NGB9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
WIPF3A6NGB9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
WIPF3A6NGB9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
WIPF3A6NGB9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
WIPF3A6NGB9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
WIPF3A6NGB9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
WIPF3A6NGB9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
WIPF3A6NGB9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
WIPF3A6NGB9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
WIPF3A6NGB9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
WIPF3A6NGB9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
WIPF3A6NGB9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
WIPF3A6NGB9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
WIPF3A6NGB9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
WIPF3A6NGB9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
WIPF3A6NGB9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
WIPF3A6NGB9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
WIPF3A6NGB9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
WIPF3A6NGB9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
WIPF3A6NGB9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
WIPF3A6NGB9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
WIPF3A6NGB9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
WIPF3A6NGB9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
WIPF3A6NGB9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
WIPF3A6NGB9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
WIPF3A6NGB9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
WIPF3A6NGB9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
WIPF3A6NGB9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
WIPF3A6NGB9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
WIPF3A6NGB9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
WIPF3A6NGB9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
WIPF3A6NGB9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
WIPF3A6NGB9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
WIPF3A6NGB9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
WIPF3A6NGB9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
WIPF3A6NGB9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
WIPF3A6NGB9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
WIPF3A6NGB9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
WIPF3A6NGB9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
WIPF3A6NGB9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
WIPF3A6NGB9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
WIPF3A6NGB9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
WIPF3A6NGB9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
WIPF3A6NGB9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
WIPF3A6NGB9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
WIPF3A6NGB9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
WIPF3A6NGB9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
WIPF3A6NGB9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
WIPF3A6NGB9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
WIPF3A6NGB9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
WIPF3A6NGB9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
WIPF3A6NGB9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
WIPF3A6NGB9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
WIPF3A6NGB9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
WIPF3A6NGB9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
WIPF3A6NGB9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
WIPF3A6NGB9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
WIPF3A6NGB9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
WIPF3A6NGB9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
WIPF3A6NGB9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
WIPF3A6NGB9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
WIPF3A6NGB9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
WIPF3A6NGB9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
WIPF3A6NGB9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
WIPF3A6NGB9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
WIPF3A6NGB9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
WIPF3A6NGB9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
WIPF3A6NGB9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
WIPF3A6NGB9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
WIPF3A6NGB9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
WIPF3A6NGB9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
WIPF3A6NGB9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
WIPF3A6NGB9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
WIPF3A6NGB9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
WIPF3A6NGB9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
WIPF3A6NGB9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
WIPF3A6NGB9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
WIPF3A6NGB9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
WIPF3A6NGB9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms