Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.123e-38■□□□□ 10.2
PCBP1Q15365 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.22e-12■□□□□ 10.2
PCBP1Q15365 ACTG1-207ENST00000574671 1678 ntTSL 1 (best)12.98□□□□□ -0.334e-27■□□□□ 10.1
PCBP1Q15365 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.17e-7■□□□□ 10.1
PCBP1Q15365 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.077e-7■□□□□ 10.1
PCBP1Q15365 SLC4A2-204ENST00000461735 4387 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.297e-7■□□□□ 10.1
PCBP1Q15365 SLC4A2-201ENST00000392826 3947 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.397e-7■□□□□ 10.1
PCBP1Q15365 SLC4A2-208ENST00000469467 442 ntTSL 211.05□□□□□ -0.647e-7■□□□□ 10.1
PCBP1Q15365 RPL5-202ENST00000370321 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.242e-20■□□□□ 10.1
PCBP1Q15365 RPL5-204ENST00000470843 694 ntTSL 34.69□□□□□ -1.662e-20■□□□□ 10.1
PCBP1Q15365 SMG7-209ENST00000495321 556 ntTSL 37.73□□□□□ -1.173e-8■□□□□ 10.1
PCBP1Q15365 TMOD3-201ENST00000308580 8255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.85e-10■□□□□ 10.1
PCBP1Q15365 TMOD3-211ENST00000561438 1139 ntTSL 58.99□□□□□ -0.975e-10■□□□□ 10.1
PCBP1Q15365 TMOD3-208ENST00000560725 544 ntTSL 47.95□□□□□ -1.145e-10■□□□□ 10.1
PCBP1Q15365 TMOD3-207ENST00000560549 1474 ntTSL 1 (best)5.36□□□□□ -1.555e-10■□□□□ 10.1
PCBP1Q15365 GPI-212ENST00000589985 1516 ntTSL 320.39■□□□□ 0.851e-6■□□□□ 10.1
PCBP1Q15365 FGFR4-216ENST00000514472 552 ntTSL 424.84■■□□□ 1.577e-15■□□□□ 10.1
PCBP1Q15365 EPS8L2-213ENST00000529346 1718 ntTSL 224.55■■□□□ 1.526e-10■□□□□ 10.1
PCBP1Q15365 FGFR4-214ENST00000513166 594 ntTSL 423.67■■□□□ 1.387e-15■□□□□ 10.1
PCBP1Q15365 FGFR4-209ENST00000507708 476 ntTSL 323.27■■□□□ 1.327e-15■□□□□ 10.1
PCBP1Q15365 FGFR4-212ENST00000510911 709 ntTSL 423.27■■□□□ 1.327e-15■□□□□ 10.1
PCBP1Q15365 DLK1-204ENST00000555747 538 ntTSL 423.23■■□□□ 1.317e-8■□□□□ 10.1
PCBP1Q15365 FGFR4-204ENST00000426612 712 ntTSL 1 (best)22.94■■□□□ 1.267e-15■□□□□ 10.1
PCBP1Q15365 FGFR4-208ENST00000503708 770 ntTSL 420.89■□□□□ 0.937e-15■□□□□ 10.1
PCBP1Q15365 FGFR4-205ENST00000430285 713 ntTSL 1 (best)18.84■□□□□ 0.617e-15■□□□□ 10.1
PCBP1Q15365 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.67e-8■□□□□ 10.1
PCBP1Q15365 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.536e-10■□□□□ 10.1
PCBP1Q15365 FMO5-205ENST00000527849 2410 ntTSL 518.04■□□□□ 0.487e-8■□□□□ 10.1
PCBP1Q15365 DLK1-203ENST00000392848 555 ntTSL 417.45■□□□□ 0.387e-8■□□□□ 10.1
PCBP1Q15365 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.196e-10■□□□□ 10.1
PCBP1Q15365 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.096e-10■□□□□ 10.1
PCBP1Q15365 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.076e-10■□□□□ 10.1
PCBP1Q15365 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.027e-8■□□□□ 10.1
PCBP1Q15365 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.026e-10■□□□□ 10.1
PCBP1Q15365 TXNDC5-203ENST00000469459 715 ntTSL 213.38□□□□□ -0.277e-8■□□□□ 10.1
PCBP1Q15365 EPS8L2-208ENST00000526909 3844 ntTSL 512.29□□□□□ -0.446e-10■□□□□ 10.1
PCBP1Q15365 FMO5-203ENST00000441068 1696 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.977e-8■□□□□ 10.1
PCBP1Q15365 F5-202ENST00000367797 7024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.997e-15■□□□□ 10.1
PCBP1Q15365 F5-201ENST00000367796 7039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -17e-15■□□□□ 10.1
PCBP1Q15365 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.115e-7■□□□□ 10.1
PCBP1Q15365 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.95e-7■□□□□ 10.1
PCBP1Q15365 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.625e-7■□□□□ 10.1
PCBP1Q15365 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.595e-7■□□□□ 10.1
PCBP1Q15365 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.253e-10■□□□□ 10.1
PCBP1Q15365 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.113e-10■□□□□ 10.1
PCBP1Q15365 C22orf39-204ENST00000509549 2979 ntTSL 212.97□□□□□ -0.335e-7■□□□□ 10.1
PCBP1Q15365 HIRA-203ENST00000452818 453 ntTSL 512.32□□□□□ -0.445e-7■□□□□ 10.1
PCBP1Q15365 C22orf39-202ENST00000399562 3350 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.445e-7■□□□□ 10.1
PCBP1Q15365 WARS-202ENST00000355338 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.593e-10■□□□□ 10.1
PCBP1Q15365 WARS-201ENST00000344102 2690 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.643e-10■□□□□ 10.1
PCBP1Q15365 WARS-220ENST00000554950 1376 ntTSL 210.71□□□□□ -0.693e-10■□□□□ 10.1
PCBP1Q15365 WARS-238ENST00000557135 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.713e-10■□□□□ 10.1
PCBP1Q15365 WARS-242ENST00000557614 499 ntTSL 29.21□□□□□ -0.943e-10■□□□□ 10.1
PCBP1Q15365 WARS-204ENST00000392882 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.033e-10■□□□□ 10.1
PCBP1Q15365 WARS-216ENST00000554601 719 ntTSL 27.44□□□□□ -1.223e-10■□□□□ 10.1
PCBP1Q15365 RPS8-207ENST00000485390 1115 ntTSL 1 (best)23.32■■□□□ 1.321e-22■□□□□ 10.1
PCBP1Q15365 RPS8-204ENST00000470475 981 ntTSL 216.37■□□□□ 0.211e-22■□□□□ 10.1
PCBP1Q15365 RPS8-208ENST00000497035 694 ntTSL 316.18■□□□□ 0.181e-22■□□□□ 10.1
PCBP1Q15365 RPS8-202ENST00000396651 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.361e-22■□□□□ 10.1
PCBP1Q15365 RPS8-201ENST00000372209 685 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.521e-22■□□□□ 10.1
PCBP1Q15365 SNORD46-201ENST00000364043 104 ntBASIC8.2□□□□□ -1.11e-22■□□□□ 10.1
PCBP1Q15365 RAD23A-205ENST00000588826 832 ntTSL 514.65□□□□□ -0.065e-10■□□□□ 10
PCBP1Q15365 CALR-206ENST00000588454 776 ntTSL 312.37□□□□□ -0.432e-7■□□□□ 10
PCBP1Q15365 FUS-209ENST00000566605 1787 ntTSL 1 (best)27.65■■■□□ 2.022e-6■□□□□ 10
PCBP1Q15365 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.862e-6■□□□□ 10
PCBP1Q15365 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.552e-6■□□□□ 10
PCBP1Q15365 SLC2A1-206ENST00000625233 1031 ntTSL 219.8■□□□□ 0.762e-6■□□□□ 10
PCBP1Q15365 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.082e-6■□□□□ 10
PCBP1Q15365 FUS-206ENST00000487509 4920 ntTSL 213.47□□□□□ -0.252e-6■□□□□ 10
PCBP1Q15365 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.549e-7■□□□□ 10
PCBP1Q15365 HNRNPL-212ENST00000601449 1918 ntTSL 518.31■□□□□ 0.529e-7■□□□□ 10
PCBP1Q15365 HNRNPL-207ENST00000598985 900 ntTSL 515.78■□□□□ 0.129e-7■□□□□ 10
PCBP1Q15365 HNRNPL-210ENST00000600873 1633 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.069e-7■□□□□ 10
PCBP1Q15365 HNRNPL-202ENST00000388749 1952 ntTSL 510.99□□□□□ -0.659e-7■□□□□ 10
PCBP1Q15365 SLC2A1-208ENST00000630287 2398 ntTSL 515.75■□□□□ 0.112e-10■□□□□ 10
PCBP1Q15365 SLC2A1-203ENST00000426263 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.532e-10■□□□□ 10
PCBP1Q15365 SERPIND1-202ENST00000406799 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.128e-7■□□□□ 10
PCBP1Q15365 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.315e-10■□□□□ 10
PCBP1Q15365 AMBP-203ENST00000540645 1356 ntTSL 214.04□□□□□ -0.165e-10■□□□□ 10
PCBP1Q15365 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.28e-19■□□□□ 10
PCBP1Q15365 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.818e-19■□□□□ 10
PCBP1Q15365 RPS14-205ENST00000519690 3119 ntTSL 215.58■□□□□ 0.088e-19■□□□□ 10
PCBP1Q15365 RPS14-207ENST00000521466 592 ntAPPRIS P1 TSL 513.42□□□□□ -0.268e-19■□□□□ 10
PCBP1Q15365 RPS14-204ENST00000518139 669 ntTSL 312.9□□□□□ -0.348e-19■□□□□ 10
PCBP1Q15365 RPS14-202ENST00000401695 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.48e-19■□□□□ 10
PCBP1Q15365 SPTBN1-204ENST00000467371 3332 ntTSL 28.34□□□□□ -1.073e-6■□□□□ 10
PCBP1Q15365 PRKCSH-201ENST00000585325 598 ntTSL 414.87□□□□□ -0.032e-6■□□□□ 9.9
PCBP1Q15365 KEL-206ENST00000476829 649 ntTSL 317.24■□□□□ 0.351e-6■□□□□ 9.9
PCBP1Q15365 KEL-209ENST00000494148 417 ntTSL 312.83□□□□□ -0.361e-6■□□□□ 9.9
PCBP1Q15365 RPL18-215ENST00000552705 1081 ntTSL 214.46□□□□□ -0.096e-12■□□□□ 9.9
PCBP1Q15365 RPL4-216ENST00000569438 565 ntTSL 516■□□□□ 0.158e-7■□□□□ 9.9
PCBP1Q15365 ARF1-204ENST00000470670 712 ntTSL 315.94■□□□□ 0.142e-12■□□□□ 9.9
PCBP1Q15365 RPL4-212ENST00000566622 817 ntTSL 215.13■□□□□ 0.018e-7■□□□□ 9.9
PCBP1Q15365 RPL4-211ENST00000566491 593 ntTSL 213.85□□□□□ -0.198e-7■□□□□ 9.9
PCBP1Q15365 RPL4-214ENST00000567229 2003 ntTSL 512.81□□□□□ -0.368e-7■□□□□ 9.9
PCBP1Q15365 RPL4-215ENST00000568588 1864 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.438e-7■□□□□ 9.9
PCBP1Q15365 RPL4-202ENST00000561554 580 ntTSL 412.17□□□□□ -0.468e-7■□□□□ 9.9
PCBP1Q15365 RPL4-213ENST00000566624 819 ntTSL 211.86□□□□□ -0.518e-7■□□□□ 9.9
PCBP1Q15365 RPL4-217ENST00000569696 569 ntTSL 511.86□□□□□ -0.518e-7■□□□□ 9.9
PCBP1Q15365 RPL4-205ENST00000564439 582 ntTSL 311.84□□□□□ -0.518e-7■□□□□ 9.9
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