Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN0

KRTAP25-1, Keratin-associated protein 25-1, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP25-1Q3LHN0 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.37□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC8.37□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 531.1 ms