Protein–RNA interactions for Protein: Q14671

PUM1, Pumilio homolog 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM1Q14671 EIF2AK1-207ENST00000470168 595 ntTSL 1 (best)6.17□□□□□ -1.425e-7■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 WARS-205ENST00000553395 801 ntTSL 56.17□□□□□ -1.425e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.435e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 RPF2-204ENST00000607388 3621 ntTSL 1 (best)6.13□□□□□ -1.435e-18■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 WARS-225ENST00000555813 410 ntTSL 46.11□□□□□ -1.435e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 KIAA1143-202ENST00000484437 507 ntTSL 56.09□□□□□ -1.431e-10■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 SEC31A-210ENST00000503058 706 ntTSL 56.08□□□□□ -1.445e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 SRPK1-211ENST00000510290 621 ntTSL 36.08□□□□□ -1.443e-8■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 SETD5-217ENST00000466242 4038 ntTSL 26.07□□□□□ -1.445e-7■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 WARS-234ENST00000556695 553 ntTSL 46.03□□□□□ -1.445e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 RNF8-206ENST00000487950 731 ntTSL 46.02□□□□□ -1.455e-7■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 FYTTD1-207ENST00000428738 718 ntTSL 55.89□□□□□ -1.473e-8■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 HMGN1-218ENST00000490032 405 ntTSL 35.83□□□□□ -1.483e-25■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 SRSF10-216ENST00000497214 526 ntTSL 35.76□□□□□ -1.495e-7■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.495e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 PPP4R3A-209ENST00000555470 595 ntTSL 35.63□□□□□ -1.513e-8■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 SRPK1-206ENST00000502969 370 ntTSL 35.62□□□□□ -1.513e-8■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.524e-13■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 RBBP6-205ENST00000562430 6482 ntTSL 1 (best)5.45□□□□□ -1.545e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 BAZ2A-207ENST00000549327 421 ntTSL 25.45□□□□□ -1.545e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 WARS-223ENST00000555410 677 ntTSL 55.42□□□□□ -1.545e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 SETD5-229ENST00000497213 552 ntTSL 45.37□□□□□ -1.555e-7■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 EIF3L-208ENST00000451427 583 ntTSL 45.36□□□□□ -1.555e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 TAX1BP1-204ENST00000416801 2221 ntTSL 25.34□□□□□ -1.555e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 WARS-221ENST00000555031 658 ntTSL 25.33□□□□□ -1.565e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 EIF3L-205ENST00000436452 574 ntTSL 45.32□□□□□ -1.565e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 RBM6-208ENST00000438912 473 ntTSL 55.06□□□□□ -1.65e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.635e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 TOP2B-202ENST00000413971 2049 ntTSL 54.83□□□□□ -1.641e-10■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 FYTTD1-209ENST00000494309 719 ntTSL 54.78□□□□□ -1.643e-8■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 PPP4R3A-204ENST00000554574 1944 ntTSL 24.42□□□□□ -1.73e-8■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 WARS-226ENST00000556209 564 ntTSL 44.22□□□□□ -1.735e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 PPA1-203ENST00000460755 412 ntTSL 54.16□□□□□ -1.745e-7■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.795e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 PPA1-204ENST00000495346 282 ntTSL 33.83□□□□□ -1.85e-7■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.835e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 SRSF10-208ENST00000469303 413 ntTSL 33.6□□□□□ -1.835e-7■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.865e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.885e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.096e-12■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 KIF20B-204ENST00000478929 4900 ntTSL 1 (best)1.32□□□□□ -2.26e-12■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.24□□□□□ -2.376e-12■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 DYNC1H1-203ENST00000554854 721 ntTSL 39.22□□□□□ -0.931e-6■□□□□ 8.4
PUM1Q14671 PRMT1-209ENST00000527866 968 ntTSL 218.61■□□□□ 0.575e-12■□□□□ 8.4
PUM1Q14671 PRMT1-216ENST00000530361 866 ntTSL 318.58■□□□□ 0.565e-12■□□□□ 8.4
PUM1Q14671 EIF4G1-227ENST00000455679 542 ntTSL 414.77□□□□□ -0.055e-12■□□□□ 8.4
PUM1Q14671 C9orf78-205ENST00000480023 2143 ntTSL 212.89□□□□□ -0.355e-12■□□□□ 8.4
PUM1Q14671 EIF4G1-214ENST00000427141 730 ntTSL 512.45□□□□□ -0.425e-12■□□□□ 8.4
PUM1Q14671 EIF4G1-228ENST00000456033 694 ntTSL 511.81□□□□□ -0.525e-12■□□□□ 8.4
PUM1Q14671 EIF4G1-220ENST00000440448 578 ntTSL 411.38□□□□□ -0.595e-12■□□□□ 8.4
PUM1Q14671 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.033e-6■□□□□ 8.4
PUM1Q14671 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.386e-7■□□□□ 8.4
PUM1Q14671 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.16e-7■□□□□ 8.4
PUM1Q14671 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.076e-7■□□□□ 8.4
PUM1Q14671 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.16e-7■□□□□ 8.4
PUM1Q14671 ZFP91-CNTF-202ENST00000422974 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 510.76□□□□□ -0.695e-7■□□□□ 8.4
PUM1Q14671 AP3D1-212ENST00000592488 707 ntTSL 317.57■□□□□ 0.45e-15■□□□□ 8.4
PUM1Q14671 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.25e-7■□□□□ 8.4
PUM1Q14671 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.165e-7■□□□□ 8.4
PUM1Q14671 MCM4-210ENST00000520934 621 ntTSL 323.34■■□□□ 1.335e-7■□□□□ 8.4
PUM1Q14671 CDK5RAP2-214ENST00000481266 970 ntTSL 522.36■■□□□ 1.175e-7■□□□□ 8.4
PUM1Q14671 MCM4-211ENST00000520994 522 ntTSL 321.09■□□□□ 0.975e-7■□□□□ 8.4
PUM1Q14671 COPS6-203ENST00000419210 218 ntTSL 320.77■□□□□ 0.925e-7■□□□□ 8.4
PUM1Q14671 COPS6-207ENST00000472107 835 ntTSL 220.54■□□□□ 0.885e-7■□□□□ 8.4
PUM1Q14671 TUFM-202ENST00000561644 294 ntTSL 219.94■□□□□ 0.785e-7■□□□□ 8.4
PUM1Q14671 COPS6-206ENST00000468499 745 ntTSL 319.83■□□□□ 0.775e-7■□□□□ 8.4
PUM1Q14671 ATXN2L-213ENST00000564162 770 ntTSL 519.27■□□□□ 0.685e-7■□□□□ 8.4
PUM1Q14671 ATXN2L-221ENST00000566946 2162 ntTSL 1 (best)19.15■□□□□ 0.665e-7■□□□□ 8.4
PUM1Q14671 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.65e-7■□□□□ 8.4
PUM1Q14671 COPS6-210ENST00000496358 610 ntTSL 218.7■□□□□ 0.585e-7■□□□□ 8.4
PUM1Q14671 COPS6-205ENST00000465027 1171 ntTSL 1 (best)18.55■□□□□ 0.565e-7■□□□□ 8.4
PUM1Q14671 TUFM-203ENST00000565012 966 ntTSL 517.7■□□□□ 0.425e-7■□□□□ 8.4
PUM1Q14671 RNF44-204ENST00000506378 848 ntTSL 217.07■□□□□ 0.325e-7■□□□□ 8.4
PUM1Q14671 RNF44-207ENST00000513029 1647 ntTSL 216.9■□□□□ 0.35e-7■□□□□ 8.4
PUM1Q14671 SF3A2-204ENST00000589118 759 ntTSL 216.89■□□□□ 0.295e-7■□□□□ 8.4
PUM1Q14671 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.295e-7■□□□□ 8.4
PUM1Q14671 ATXN2L-208ENST00000562583 1933 ntTSL 1 (best)16.84■□□□□ 0.295e-7■□□□□ 8.4
PUM1Q14671 SF3A2-202ENST00000586396 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 316.71■□□□□ 0.275e-7■□□□□ 8.4
PUM1Q14671 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.265e-7■□□□□ 8.4
PUM1Q14671 SF3A2-206ENST00000592314 885 ntTSL 516.4■□□□□ 0.225e-7■□□□□ 8.4
PUM1Q14671 RNF44-205ENST00000508478 662 ntTSL 315.91■□□□□ 0.145e-7■□□□□ 8.4
PUM1Q14671 SF3A2-207ENST00000592839 724 ntTSL 215.67■□□□□ 0.15e-7■□□□□ 8.4
PUM1Q14671 SF3A2-205ENST00000590034 573 ntTSL 315.24■□□□□ 0.035e-7■□□□□ 8.4
PUM1Q14671 SRRT-214ENST00000614370 556 ntTSL 215.21■□□□□ 0.035e-7■□□□□ 8.4
PUM1Q14671 ADAMTSL4-205ENST00000483335 1826 ntTSL 1 (best)15.06■□□□□ 05e-7■□□□□ 8.4
PUM1Q14671 ATXN2L-218ENST00000565971 3264 ntTSL 1 (best)14.11□□□□□ -0.155e-7■□□□□ 8.4
PUM1Q14671 FADS3-203ENST00000525094 403 ntTSL 514.07□□□□□ -0.165e-7■□□□□ 8.4
PUM1Q14671 IGF2BP2-205ENST00000461957 509 ntTSL 513.76□□□□□ -0.214e-13■□□□□ 8.4
PUM1Q14671 MCM4-216ENST00000524086 547 ntTSL 513.66□□□□□ -0.225e-7■□□□□ 8.4
PUM1Q14671 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.275e-7■□□□□ 8.4
PUM1Q14671 SRRT-202ENST00000431645 397 ntTSL 212.74□□□□□ -0.375e-7■□□□□ 8.4
PUM1Q14671 KRT18-205ENST00000548496 695 ntTSL 211.9□□□□□ -0.55e-7■□□□□ 8.4
PUM1Q14671 BLOC1S5-TXNDC5-201ENST00000439343 3030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.65e-7■□□□□ 8.4
PUM1Q14671 MCM4-203ENST00000518221 572 ntTSL 411.27□□□□□ -0.615e-7■□□□□ 8.4
PUM1Q14671 ATXN2L-219ENST00000566007 471 ntTSL 39.79□□□□□ -0.845e-7■□□□□ 8.4
PUM1Q14671 CDK5RAP2-208ENST00000472883 389 ntTSL 38.99□□□□□ -0.975e-7■□□□□ 8.4
PUM1Q14671 IGF2BP2-209ENST00000493302 358 ntTSL 57.29□□□□□ -1.244e-13■□□□□ 8.4
PUM1Q14671 SMNDC1-205ENST00000477763 778 ntTSL 25.88□□□□□ -1.475e-7■□□□□ 8.4
PUM1Q14671 SMNDC1-204ENST00000471297 823 ntTSL 35.63□□□□□ -1.515e-7■□□□□ 8.4
PUM1Q14671 PA2G4-205ENST00000552528 289 ntTSL 24.94□□□□□ -1.625e-7■□□□□ 8.4
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