Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q6R5

CRIP3, Cysteine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP3Q6Q6R5 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRIP3Q6Q6R5 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms