Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HCN4Q9Y3Q4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HCN4Q9Y3Q4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HCN4Q9Y3Q4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HCN4Q9Y3Q4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HCN4Q9Y3Q4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
HCN4Q9Y3Q4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HCN4Q9Y3Q4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HCN4Q9Y3Q4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HCN4Q9Y3Q4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HCN4Q9Y3Q4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HCN4Q9Y3Q4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
HCN4Q9Y3Q4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HCN4Q9Y3Q4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HCN4Q9Y3Q4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HCN4Q9Y3Q4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HCN4Q9Y3Q4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HCN4Q9Y3Q4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HCN4Q9Y3Q4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
HCN4Q9Y3Q4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
HCN4Q9Y3Q4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HCN4Q9Y3Q4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HCN4Q9Y3Q4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HCN4Q9Y3Q4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
HCN4Q9Y3Q4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HCN4Q9Y3Q4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HCN4Q9Y3Q4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HCN4Q9Y3Q4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HCN4Q9Y3Q4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HCN4Q9Y3Q4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HCN4Q9Y3Q4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HCN4Q9Y3Q4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HCN4Q9Y3Q4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HCN4Q9Y3Q4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
HCN4Q9Y3Q4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
HCN4Q9Y3Q4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HCN4Q9Y3Q4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HCN4Q9Y3Q4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HCN4Q9Y3Q4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HCN4Q9Y3Q4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HCN4Q9Y3Q4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HCN4Q9Y3Q4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HCN4Q9Y3Q4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
HCN4Q9Y3Q4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HCN4Q9Y3Q4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
HCN4Q9Y3Q4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HCN4Q9Y3Q4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
HCN4Q9Y3Q4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HCN4Q9Y3Q4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HCN4Q9Y3Q4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HCN4Q9Y3Q4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HCN4Q9Y3Q4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HCN4Q9Y3Q4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HCN4Q9Y3Q4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HCN4Q9Y3Q4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HCN4Q9Y3Q4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HCN4Q9Y3Q4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HCN4Q9Y3Q4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HCN4Q9Y3Q4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HCN4Q9Y3Q4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HCN4Q9Y3Q4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HCN4Q9Y3Q4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HCN4Q9Y3Q4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HCN4Q9Y3Q4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HCN4Q9Y3Q4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
HCN4Q9Y3Q4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HCN4Q9Y3Q4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HCN4Q9Y3Q4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HCN4Q9Y3Q4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HCN4Q9Y3Q4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HCN4Q9Y3Q4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HCN4Q9Y3Q4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HCN4Q9Y3Q4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HCN4Q9Y3Q4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HCN4Q9Y3Q4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HCN4Q9Y3Q4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HCN4Q9Y3Q4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HCN4Q9Y3Q4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HCN4Q9Y3Q4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HCN4Q9Y3Q4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HCN4Q9Y3Q4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HCN4Q9Y3Q4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HCN4Q9Y3Q4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HCN4Q9Y3Q4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HCN4Q9Y3Q4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HCN4Q9Y3Q4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HCN4Q9Y3Q4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HCN4Q9Y3Q4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HCN4Q9Y3Q4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HCN4Q9Y3Q4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HCN4Q9Y3Q4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HCN4Q9Y3Q4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HCN4Q9Y3Q4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HCN4Q9Y3Q4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
HCN4Q9Y3Q4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HCN4Q9Y3Q4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HCN4Q9Y3Q4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HCN4Q9Y3Q4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HCN4Q9Y3Q4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HCN4Q9Y3Q4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms