Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNL2

SSR3, Translocon-associated protein subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR3Q9UNL2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSR3Q9UNL2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSR3Q9UNL2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSR3Q9UNL2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSR3Q9UNL2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSR3Q9UNL2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSR3Q9UNL2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSR3Q9UNL2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSR3Q9UNL2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSR3Q9UNL2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSR3Q9UNL2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSR3Q9UNL2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSR3Q9UNL2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSR3Q9UNL2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSR3Q9UNL2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSR3Q9UNL2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSR3Q9UNL2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSR3Q9UNL2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSR3Q9UNL2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSR3Q9UNL2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSR3Q9UNL2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSR3Q9UNL2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSR3Q9UNL2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSR3Q9UNL2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSR3Q9UNL2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSR3Q9UNL2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSR3Q9UNL2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSR3Q9UNL2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSR3Q9UNL2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSR3Q9UNL2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSR3Q9UNL2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSR3Q9UNL2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SSR3Q9UNL2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSR3Q9UNL2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSR3Q9UNL2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSR3Q9UNL2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSR3Q9UNL2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSR3Q9UNL2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSR3Q9UNL2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSR3Q9UNL2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSR3Q9UNL2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSR3Q9UNL2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSR3Q9UNL2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSR3Q9UNL2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSR3Q9UNL2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSR3Q9UNL2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSR3Q9UNL2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSR3Q9UNL2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SSR3Q9UNL2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSR3Q9UNL2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSR3Q9UNL2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSR3Q9UNL2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSR3Q9UNL2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSR3Q9UNL2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSR3Q9UNL2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSR3Q9UNL2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSR3Q9UNL2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSR3Q9UNL2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSR3Q9UNL2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSR3Q9UNL2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSR3Q9UNL2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSR3Q9UNL2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSR3Q9UNL2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSR3Q9UNL2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSR3Q9UNL2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSR3Q9UNL2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSR3Q9UNL2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SSR3Q9UNL2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSR3Q9UNL2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSR3Q9UNL2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSR3Q9UNL2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSR3Q9UNL2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSR3Q9UNL2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SSR3Q9UNL2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SSR3Q9UNL2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SSR3Q9UNL2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SSR3Q9UNL2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SSR3Q9UNL2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SSR3Q9UNL2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSR3Q9UNL2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSR3Q9UNL2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSR3Q9UNL2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSR3Q9UNL2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSR3Q9UNL2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSR3Q9UNL2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSR3Q9UNL2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSR3Q9UNL2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSR3Q9UNL2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSR3Q9UNL2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSR3Q9UNL2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSR3Q9UNL2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSR3Q9UNL2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSR3Q9UNL2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SSR3Q9UNL2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSR3Q9UNL2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSR3Q9UNL2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSR3Q9UNL2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SSR3Q9UNL2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSR3Q9UNL2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSR3Q9UNL2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms