Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKU7

ACAD8, Isobutyryl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAD8Q9UKU7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACAD8Q9UKU7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ACAD8Q9UKU7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACAD8Q9UKU7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACAD8Q9UKU7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACAD8Q9UKU7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACAD8Q9UKU7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACAD8Q9UKU7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACAD8Q9UKU7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACAD8Q9UKU7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACAD8Q9UKU7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACAD8Q9UKU7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACAD8Q9UKU7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACAD8Q9UKU7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACAD8Q9UKU7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACAD8Q9UKU7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ACAD8Q9UKU7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACAD8Q9UKU7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACAD8Q9UKU7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACAD8Q9UKU7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACAD8Q9UKU7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACAD8Q9UKU7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACAD8Q9UKU7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACAD8Q9UKU7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACAD8Q9UKU7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACAD8Q9UKU7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACAD8Q9UKU7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACAD8Q9UKU7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACAD8Q9UKU7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACAD8Q9UKU7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACAD8Q9UKU7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACAD8Q9UKU7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACAD8Q9UKU7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACAD8Q9UKU7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACAD8Q9UKU7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACAD8Q9UKU7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACAD8Q9UKU7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ACAD8Q9UKU7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACAD8Q9UKU7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACAD8Q9UKU7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACAD8Q9UKU7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACAD8Q9UKU7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ACAD8Q9UKU7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACAD8Q9UKU7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACAD8Q9UKU7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACAD8Q9UKU7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACAD8Q9UKU7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACAD8Q9UKU7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACAD8Q9UKU7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ACAD8Q9UKU7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACAD8Q9UKU7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACAD8Q9UKU7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACAD8Q9UKU7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACAD8Q9UKU7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACAD8Q9UKU7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACAD8Q9UKU7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACAD8Q9UKU7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACAD8Q9UKU7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACAD8Q9UKU7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACAD8Q9UKU7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACAD8Q9UKU7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACAD8Q9UKU7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACAD8Q9UKU7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACAD8Q9UKU7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACAD8Q9UKU7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ACAD8Q9UKU7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACAD8Q9UKU7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACAD8Q9UKU7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACAD8Q9UKU7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACAD8Q9UKU7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACAD8Q9UKU7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACAD8Q9UKU7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACAD8Q9UKU7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACAD8Q9UKU7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACAD8Q9UKU7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACAD8Q9UKU7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACAD8Q9UKU7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACAD8Q9UKU7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACAD8Q9UKU7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACAD8Q9UKU7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACAD8Q9UKU7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ACAD8Q9UKU7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACAD8Q9UKU7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACAD8Q9UKU7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACAD8Q9UKU7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACAD8Q9UKU7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACAD8Q9UKU7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACAD8Q9UKU7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACAD8Q9UKU7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACAD8Q9UKU7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACAD8Q9UKU7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACAD8Q9UKU7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACAD8Q9UKU7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACAD8Q9UKU7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACAD8Q9UKU7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACAD8Q9UKU7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACAD8Q9UKU7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACAD8Q9UKU7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACAD8Q9UKU7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACAD8Q9UKU7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms