Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJA3

MCM8, DNA helicase MCM8, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM8Q9UJA3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCM8Q9UJA3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCM8Q9UJA3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCM8Q9UJA3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCM8Q9UJA3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCM8Q9UJA3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCM8Q9UJA3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
MCM8Q9UJA3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCM8Q9UJA3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
MCM8Q9UJA3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MCM8Q9UJA3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MCM8Q9UJA3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MCM8Q9UJA3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MCM8Q9UJA3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MCM8Q9UJA3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MCM8Q9UJA3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MCM8Q9UJA3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MCM8Q9UJA3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MCM8Q9UJA3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MCM8Q9UJA3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCM8Q9UJA3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCM8Q9UJA3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCM8Q9UJA3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCM8Q9UJA3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCM8Q9UJA3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCM8Q9UJA3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCM8Q9UJA3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MCM8Q9UJA3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCM8Q9UJA3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCM8Q9UJA3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCM8Q9UJA3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCM8Q9UJA3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCM8Q9UJA3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCM8Q9UJA3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCM8Q9UJA3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCM8Q9UJA3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCM8Q9UJA3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCM8Q9UJA3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCM8Q9UJA3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MCM8Q9UJA3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCM8Q9UJA3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCM8Q9UJA3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCM8Q9UJA3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCM8Q9UJA3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCM8Q9UJA3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCM8Q9UJA3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCM8Q9UJA3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCM8Q9UJA3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCM8Q9UJA3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCM8Q9UJA3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCM8Q9UJA3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCM8Q9UJA3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCM8Q9UJA3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCM8Q9UJA3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCM8Q9UJA3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCM8Q9UJA3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCM8Q9UJA3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCM8Q9UJA3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCM8Q9UJA3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCM8Q9UJA3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCM8Q9UJA3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCM8Q9UJA3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCM8Q9UJA3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCM8Q9UJA3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCM8Q9UJA3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
MCM8Q9UJA3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCM8Q9UJA3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCM8Q9UJA3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCM8Q9UJA3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCM8Q9UJA3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCM8Q9UJA3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCM8Q9UJA3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCM8Q9UJA3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCM8Q9UJA3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCM8Q9UJA3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MCM8Q9UJA3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MCM8Q9UJA3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCM8Q9UJA3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCM8Q9UJA3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCM8Q9UJA3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
MCM8Q9UJA3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MCM8Q9UJA3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MCM8Q9UJA3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MCM8Q9UJA3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCM8Q9UJA3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCM8Q9UJA3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCM8Q9UJA3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCM8Q9UJA3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCM8Q9UJA3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCM8Q9UJA3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCM8Q9UJA3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCM8Q9UJA3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCM8Q9UJA3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCM8Q9UJA3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCM8Q9UJA3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCM8Q9UJA3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCM8Q9UJA3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCM8Q9UJA3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCM8Q9UJA3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCM8Q9UJA3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms