Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBS0

RPS6KB2, Ribosomal protein S6 kinase beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB2Q9UBS0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPS6KB2Q9UBS0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPS6KB2Q9UBS0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPS6KB2Q9UBS0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPS6KB2Q9UBS0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPS6KB2Q9UBS0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPS6KB2Q9UBS0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPS6KB2Q9UBS0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPS6KB2Q9UBS0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPS6KB2Q9UBS0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RPS6KB2Q9UBS0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPS6KB2Q9UBS0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPS6KB2Q9UBS0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPS6KB2Q9UBS0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPS6KB2Q9UBS0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPS6KB2Q9UBS0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPS6KB2Q9UBS0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPS6KB2Q9UBS0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPS6KB2Q9UBS0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPS6KB2Q9UBS0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPS6KB2Q9UBS0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPS6KB2Q9UBS0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPS6KB2Q9UBS0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RPS6KB2Q9UBS0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS6KB2Q9UBS0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS6KB2Q9UBS0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS6KB2Q9UBS0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS6KB2Q9UBS0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS6KB2Q9UBS0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS6KB2Q9UBS0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS6KB2Q9UBS0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS6KB2Q9UBS0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS6KB2Q9UBS0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS6KB2Q9UBS0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS6KB2Q9UBS0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS6KB2Q9UBS0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS6KB2Q9UBS0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS6KB2Q9UBS0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS6KB2Q9UBS0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS6KB2Q9UBS0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS6KB2Q9UBS0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS6KB2Q9UBS0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS6KB2Q9UBS0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS6KB2Q9UBS0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS6KB2Q9UBS0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS6KB2Q9UBS0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS6KB2Q9UBS0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS6KB2Q9UBS0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS6KB2Q9UBS0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS6KB2Q9UBS0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS6KB2Q9UBS0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS6KB2Q9UBS0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS6KB2Q9UBS0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS6KB2Q9UBS0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS6KB2Q9UBS0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS6KB2Q9UBS0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS6KB2Q9UBS0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS6KB2Q9UBS0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS6KB2Q9UBS0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS6KB2Q9UBS0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS6KB2Q9UBS0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS6KB2Q9UBS0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS6KB2Q9UBS0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS6KB2Q9UBS0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS6KB2Q9UBS0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS6KB2Q9UBS0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS6KB2Q9UBS0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS6KB2Q9UBS0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS6KB2Q9UBS0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS6KB2Q9UBS0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS6KB2Q9UBS0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS6KB2Q9UBS0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS6KB2Q9UBS0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS6KB2Q9UBS0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS6KB2Q9UBS0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS6KB2Q9UBS0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS6KB2Q9UBS0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS6KB2Q9UBS0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS6KB2Q9UBS0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS6KB2Q9UBS0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS6KB2Q9UBS0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS6KB2Q9UBS0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS6KB2Q9UBS0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS6KB2Q9UBS0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS6KB2Q9UBS0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS6KB2Q9UBS0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS6KB2Q9UBS0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS6KB2Q9UBS0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS6KB2Q9UBS0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS6KB2Q9UBS0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS6KB2Q9UBS0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS6KB2Q9UBS0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS6KB2Q9UBS0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS6KB2Q9UBS0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS6KB2Q9UBS0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS6KB2Q9UBS0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RPS6KB2Q9UBS0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RPS6KB2Q9UBS0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPS6KB2Q9UBS0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPS6KB2Q9UBS0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms