Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK7

RABL2A, Rab-like protein 2A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABL2AQ9UBK7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RABL2AQ9UBK7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RABL2AQ9UBK7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RABL2AQ9UBK7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RABL2AQ9UBK7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RABL2AQ9UBK7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RABL2AQ9UBK7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RABL2AQ9UBK7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RABL2AQ9UBK7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RABL2AQ9UBK7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RABL2AQ9UBK7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RABL2AQ9UBK7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RABL2AQ9UBK7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RABL2AQ9UBK7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RABL2AQ9UBK7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
RABL2AQ9UBK7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RABL2AQ9UBK7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RABL2AQ9UBK7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RABL2AQ9UBK7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RABL2AQ9UBK7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RABL2AQ9UBK7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RABL2AQ9UBK7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RABL2AQ9UBK7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RABL2AQ9UBK7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RABL2AQ9UBK7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RABL2AQ9UBK7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RABL2AQ9UBK7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RABL2AQ9UBK7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RABL2AQ9UBK7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RABL2AQ9UBK7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RABL2AQ9UBK7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RABL2AQ9UBK7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RABL2AQ9UBK7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RABL2AQ9UBK7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RABL2AQ9UBK7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RABL2AQ9UBK7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RABL2AQ9UBK7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RABL2AQ9UBK7 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RABL2AQ9UBK7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RABL2AQ9UBK7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RABL2AQ9UBK7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RABL2AQ9UBK7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RABL2AQ9UBK7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RABL2AQ9UBK7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RABL2AQ9UBK7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RABL2AQ9UBK7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RABL2AQ9UBK7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RABL2AQ9UBK7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RABL2AQ9UBK7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RABL2AQ9UBK7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RABL2AQ9UBK7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RABL2AQ9UBK7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RABL2AQ9UBK7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RABL2AQ9UBK7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RABL2AQ9UBK7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RABL2AQ9UBK7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RABL2AQ9UBK7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RABL2AQ9UBK7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RABL2AQ9UBK7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RABL2AQ9UBK7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RABL2AQ9UBK7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RABL2AQ9UBK7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RABL2AQ9UBK7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RABL2AQ9UBK7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RABL2AQ9UBK7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RABL2AQ9UBK7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RABL2AQ9UBK7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RABL2AQ9UBK7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RABL2AQ9UBK7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RABL2AQ9UBK7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RABL2AQ9UBK7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RABL2AQ9UBK7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RABL2AQ9UBK7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RABL2AQ9UBK7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RABL2AQ9UBK7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RABL2AQ9UBK7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RABL2AQ9UBK7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RABL2AQ9UBK7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RABL2AQ9UBK7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RABL2AQ9UBK7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RABL2AQ9UBK7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RABL2AQ9UBK7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RABL2AQ9UBK7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RABL2AQ9UBK7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RABL2AQ9UBK7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RABL2AQ9UBK7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RABL2AQ9UBK7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RABL2AQ9UBK7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RABL2AQ9UBK7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RABL2AQ9UBK7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
RABL2AQ9UBK7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.33■■□□□ 1
RABL2AQ9UBK7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RABL2AQ9UBK7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RABL2AQ9UBK7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RABL2AQ9UBK7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RABL2AQ9UBK7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RABL2AQ9UBK7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RABL2AQ9UBK7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RABL2AQ9UBK7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RABL2AQ9UBK7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms