Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0U4

CXXC1, CXXC-type zinc finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXXC1Q9P0U4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CXXC1Q9P0U4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CXXC1Q9P0U4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CXXC1Q9P0U4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CXXC1Q9P0U4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CXXC1Q9P0U4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CXXC1Q9P0U4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CXXC1Q9P0U4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CXXC1Q9P0U4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CXXC1Q9P0U4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CXXC1Q9P0U4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CXXC1Q9P0U4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CXXC1Q9P0U4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CXXC1Q9P0U4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CXXC1Q9P0U4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CXXC1Q9P0U4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CXXC1Q9P0U4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CXXC1Q9P0U4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CXXC1Q9P0U4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CXXC1Q9P0U4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CXXC1Q9P0U4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CXXC1Q9P0U4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CXXC1Q9P0U4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CXXC1Q9P0U4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CXXC1Q9P0U4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CXXC1Q9P0U4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CXXC1Q9P0U4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CXXC1Q9P0U4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CXXC1Q9P0U4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CXXC1Q9P0U4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CXXC1Q9P0U4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CXXC1Q9P0U4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CXXC1Q9P0U4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CXXC1Q9P0U4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CXXC1Q9P0U4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CXXC1Q9P0U4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CXXC1Q9P0U4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CXXC1Q9P0U4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CXXC1Q9P0U4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CXXC1Q9P0U4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CXXC1Q9P0U4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CXXC1Q9P0U4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CXXC1Q9P0U4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CXXC1Q9P0U4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CXXC1Q9P0U4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CXXC1Q9P0U4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CXXC1Q9P0U4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CXXC1Q9P0U4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CXXC1Q9P0U4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CXXC1Q9P0U4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CXXC1Q9P0U4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CXXC1Q9P0U4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CXXC1Q9P0U4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CXXC1Q9P0U4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CXXC1Q9P0U4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CXXC1Q9P0U4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CXXC1Q9P0U4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CXXC1Q9P0U4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CXXC1Q9P0U4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CXXC1Q9P0U4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CXXC1Q9P0U4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CXXC1Q9P0U4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CXXC1Q9P0U4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CXXC1Q9P0U4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CXXC1Q9P0U4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CXXC1Q9P0U4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CXXC1Q9P0U4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CXXC1Q9P0U4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CXXC1Q9P0U4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CXXC1Q9P0U4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CXXC1Q9P0U4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CXXC1Q9P0U4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CXXC1Q9P0U4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CXXC1Q9P0U4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CXXC1Q9P0U4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CXXC1Q9P0U4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CXXC1Q9P0U4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CXXC1Q9P0U4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CXXC1Q9P0U4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CXXC1Q9P0U4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CXXC1Q9P0U4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CXXC1Q9P0U4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CXXC1Q9P0U4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CXXC1Q9P0U4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CXXC1Q9P0U4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CXXC1Q9P0U4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CXXC1Q9P0U4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CXXC1Q9P0U4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CXXC1Q9P0U4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CXXC1Q9P0U4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CXXC1Q9P0U4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CXXC1Q9P0U4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CXXC1Q9P0U4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CXXC1Q9P0U4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CXXC1Q9P0U4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CXXC1Q9P0U4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CXXC1Q9P0U4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CXXC1Q9P0U4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CXXC1Q9P0U4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CXXC1Q9P0U4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms