Protein–RNA interactions for Protein: Q9P031

CCDC59, Thyroid transcription factor 1-associated protein 26, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC59Q9P031 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC59Q9P031 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC59Q9P031 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC59Q9P031 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC59Q9P031 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC59Q9P031 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC59Q9P031 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC59Q9P031 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC59Q9P031 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC59Q9P031 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC59Q9P031 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC59Q9P031 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC59Q9P031 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC59Q9P031 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC59Q9P031 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC59Q9P031 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC59Q9P031 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC59Q9P031 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC59Q9P031 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC59Q9P031 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC59Q9P031 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC59Q9P031 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC59Q9P031 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC59Q9P031 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC59Q9P031 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC59Q9P031 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC59Q9P031 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC59Q9P031 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC59Q9P031 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC59Q9P031 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC59Q9P031 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC59Q9P031 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC59Q9P031 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC59Q9P031 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC59Q9P031 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC59Q9P031 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC59Q9P031 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC59Q9P031 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC59Q9P031 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC59Q9P031 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC59Q9P031 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC59Q9P031 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC59Q9P031 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC59Q9P031 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC59Q9P031 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC59Q9P031 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC59Q9P031 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC59Q9P031 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC59Q9P031 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC59Q9P031 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC59Q9P031 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC59Q9P031 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC59Q9P031 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC59Q9P031 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC59Q9P031 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC59Q9P031 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC59Q9P031 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC59Q9P031 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC59Q9P031 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC59Q9P031 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC59Q9P031 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC59Q9P031 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC59Q9P031 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC59Q9P031 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC59Q9P031 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC59Q9P031 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC59Q9P031 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC59Q9P031 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC59Q9P031 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC59Q9P031 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC59Q9P031 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC59Q9P031 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC59Q9P031 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC59Q9P031 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC59Q9P031 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC59Q9P031 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC59Q9P031 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC59Q9P031 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC59Q9P031 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC59Q9P031 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC59Q9P031 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC59Q9P031 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC59Q9P031 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC59Q9P031 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC59Q9P031 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC59Q9P031 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC59Q9P031 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC59Q9P031 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC59Q9P031 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC59Q9P031 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC59Q9P031 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC59Q9P031 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC59Q9P031 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC59Q9P031 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC59Q9P031 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC59Q9P031 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC59Q9P031 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC59Q9P031 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC59Q9P031 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC59Q9P031 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms