Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU5

LMCD1, LIM and cysteine-rich domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMCD1Q9NZU5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LMCD1Q9NZU5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LMCD1Q9NZU5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
LMCD1Q9NZU5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LMCD1Q9NZU5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LMCD1Q9NZU5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LMCD1Q9NZU5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LMCD1Q9NZU5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
LMCD1Q9NZU5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LMCD1Q9NZU5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LMCD1Q9NZU5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
LMCD1Q9NZU5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LMCD1Q9NZU5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LMCD1Q9NZU5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LMCD1Q9NZU5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMCD1Q9NZU5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMCD1Q9NZU5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMCD1Q9NZU5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMCD1Q9NZU5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMCD1Q9NZU5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
LMCD1Q9NZU5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMCD1Q9NZU5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMCD1Q9NZU5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMCD1Q9NZU5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMCD1Q9NZU5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMCD1Q9NZU5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMCD1Q9NZU5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMCD1Q9NZU5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMCD1Q9NZU5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
LMCD1Q9NZU5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMCD1Q9NZU5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LMCD1Q9NZU5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LMCD1Q9NZU5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
LMCD1Q9NZU5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
LMCD1Q9NZU5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LMCD1Q9NZU5 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMCD1Q9NZU5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMCD1Q9NZU5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMCD1Q9NZU5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMCD1Q9NZU5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMCD1Q9NZU5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMCD1Q9NZU5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMCD1Q9NZU5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
LMCD1Q9NZU5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMCD1Q9NZU5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMCD1Q9NZU5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMCD1Q9NZU5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMCD1Q9NZU5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMCD1Q9NZU5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMCD1Q9NZU5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMCD1Q9NZU5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMCD1Q9NZU5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
LMCD1Q9NZU5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMCD1Q9NZU5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMCD1Q9NZU5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMCD1Q9NZU5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMCD1Q9NZU5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
LMCD1Q9NZU5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMCD1Q9NZU5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMCD1Q9NZU5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMCD1Q9NZU5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMCD1Q9NZU5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMCD1Q9NZU5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMCD1Q9NZU5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
LMCD1Q9NZU5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMCD1Q9NZU5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMCD1Q9NZU5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMCD1Q9NZU5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMCD1Q9NZU5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMCD1Q9NZU5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
LMCD1Q9NZU5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMCD1Q9NZU5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
LMCD1Q9NZU5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
LMCD1Q9NZU5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMCD1Q9NZU5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMCD1Q9NZU5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LMCD1Q9NZU5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LMCD1Q9NZU5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LMCD1Q9NZU5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LMCD1Q9NZU5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
LMCD1Q9NZU5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LMCD1Q9NZU5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LMCD1Q9NZU5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LMCD1Q9NZU5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LMCD1Q9NZU5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LMCD1Q9NZU5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LMCD1Q9NZU5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LMCD1Q9NZU5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LMCD1Q9NZU5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LMCD1Q9NZU5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LMCD1Q9NZU5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LMCD1Q9NZU5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LMCD1Q9NZU5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LMCD1Q9NZU5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LMCD1Q9NZU5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
LMCD1Q9NZU5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LMCD1Q9NZU5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LMCD1Q9NZU5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LMCD1Q9NZU5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LMCD1Q9NZU5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms