Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR2

LRP1B, Low-density lipoprotein receptor-related protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 4,599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1BQ9NZR2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRP1BQ9NZR2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LRP1BQ9NZR2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LRP1BQ9NZR2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRP1BQ9NZR2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRP1BQ9NZR2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRP1BQ9NZR2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRP1BQ9NZR2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRP1BQ9NZR2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRP1BQ9NZR2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRP1BQ9NZR2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRP1BQ9NZR2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRP1BQ9NZR2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRP1BQ9NZR2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRP1BQ9NZR2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRP1BQ9NZR2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRP1BQ9NZR2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRP1BQ9NZR2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRP1BQ9NZR2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRP1BQ9NZR2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRP1BQ9NZR2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRP1BQ9NZR2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRP1BQ9NZR2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRP1BQ9NZR2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRP1BQ9NZR2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRP1BQ9NZR2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRP1BQ9NZR2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRP1BQ9NZR2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LRP1BQ9NZR2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRP1BQ9NZR2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRP1BQ9NZR2 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRP1BQ9NZR2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRP1BQ9NZR2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LRP1BQ9NZR2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRP1BQ9NZR2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRP1BQ9NZR2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRP1BQ9NZR2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRP1BQ9NZR2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
LRP1BQ9NZR2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
LRP1BQ9NZR2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRP1BQ9NZR2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRP1BQ9NZR2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRP1BQ9NZR2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRP1BQ9NZR2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRP1BQ9NZR2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRP1BQ9NZR2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRP1BQ9NZR2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRP1BQ9NZR2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRP1BQ9NZR2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRP1BQ9NZR2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRP1BQ9NZR2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRP1BQ9NZR2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LRP1BQ9NZR2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRP1BQ9NZR2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRP1BQ9NZR2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRP1BQ9NZR2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRP1BQ9NZR2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LRP1BQ9NZR2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRP1BQ9NZR2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRP1BQ9NZR2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRP1BQ9NZR2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LRP1BQ9NZR2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRP1BQ9NZR2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRP1BQ9NZR2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRP1BQ9NZR2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LRP1BQ9NZR2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRP1BQ9NZR2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRP1BQ9NZR2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRP1BQ9NZR2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRP1BQ9NZR2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LRP1BQ9NZR2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRP1BQ9NZR2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRP1BQ9NZR2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRP1BQ9NZR2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRP1BQ9NZR2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRP1BQ9NZR2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRP1BQ9NZR2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRP1BQ9NZR2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRP1BQ9NZR2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRP1BQ9NZR2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRP1BQ9NZR2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRP1BQ9NZR2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRP1BQ9NZR2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRP1BQ9NZR2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRP1BQ9NZR2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
LRP1BQ9NZR2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRP1BQ9NZR2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRP1BQ9NZR2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRP1BQ9NZR2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRP1BQ9NZR2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRP1BQ9NZR2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRP1BQ9NZR2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRP1BQ9NZR2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRP1BQ9NZR2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRP1BQ9NZR2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRP1BQ9NZR2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRP1BQ9NZR2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LRP1BQ9NZR2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRP1BQ9NZR2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRP1BQ9NZR2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms