Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ3

NCKIPSD, NCK-interacting protein with SH3 domain, humanhuman

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKIPSDQ9NZQ3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NCKIPSDQ9NZQ3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NCKIPSDQ9NZQ3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NCKIPSDQ9NZQ3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NCKIPSDQ9NZQ3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NCKIPSDQ9NZQ3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NCKIPSDQ9NZQ3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NCKIPSDQ9NZQ3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NCKIPSDQ9NZQ3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NCKIPSDQ9NZQ3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NCKIPSDQ9NZQ3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NCKIPSDQ9NZQ3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NCKIPSDQ9NZQ3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NCKIPSDQ9NZQ3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NCKIPSDQ9NZQ3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NCKIPSDQ9NZQ3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NCKIPSDQ9NZQ3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NCKIPSDQ9NZQ3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NCKIPSDQ9NZQ3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NCKIPSDQ9NZQ3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NCKIPSDQ9NZQ3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NCKIPSDQ9NZQ3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NCKIPSDQ9NZQ3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NCKIPSDQ9NZQ3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NCKIPSDQ9NZQ3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NCKIPSDQ9NZQ3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NCKIPSDQ9NZQ3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NCKIPSDQ9NZQ3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NCKIPSDQ9NZQ3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NCKIPSDQ9NZQ3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NCKIPSDQ9NZQ3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NCKIPSDQ9NZQ3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NCKIPSDQ9NZQ3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NCKIPSDQ9NZQ3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NCKIPSDQ9NZQ3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NCKIPSDQ9NZQ3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NCKIPSDQ9NZQ3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NCKIPSDQ9NZQ3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NCKIPSDQ9NZQ3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NCKIPSDQ9NZQ3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NCKIPSDQ9NZQ3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NCKIPSDQ9NZQ3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NCKIPSDQ9NZQ3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NCKIPSDQ9NZQ3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NCKIPSDQ9NZQ3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NCKIPSDQ9NZQ3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NCKIPSDQ9NZQ3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NCKIPSDQ9NZQ3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NCKIPSDQ9NZQ3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NCKIPSDQ9NZQ3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NCKIPSDQ9NZQ3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NCKIPSDQ9NZQ3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NCKIPSDQ9NZQ3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NCKIPSDQ9NZQ3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NCKIPSDQ9NZQ3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NCKIPSDQ9NZQ3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NCKIPSDQ9NZQ3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NCKIPSDQ9NZQ3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NCKIPSDQ9NZQ3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NCKIPSDQ9NZQ3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NCKIPSDQ9NZQ3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NCKIPSDQ9NZQ3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NCKIPSDQ9NZQ3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NCKIPSDQ9NZQ3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NCKIPSDQ9NZQ3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NCKIPSDQ9NZQ3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NCKIPSDQ9NZQ3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NCKIPSDQ9NZQ3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NCKIPSDQ9NZQ3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NCKIPSDQ9NZQ3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NCKIPSDQ9NZQ3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NCKIPSDQ9NZQ3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NCKIPSDQ9NZQ3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCKIPSDQ9NZQ3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCKIPSDQ9NZQ3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCKIPSDQ9NZQ3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCKIPSDQ9NZQ3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NCKIPSDQ9NZQ3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCKIPSDQ9NZQ3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCKIPSDQ9NZQ3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCKIPSDQ9NZQ3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCKIPSDQ9NZQ3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCKIPSDQ9NZQ3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCKIPSDQ9NZQ3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCKIPSDQ9NZQ3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NCKIPSDQ9NZQ3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
NCKIPSDQ9NZQ3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NCKIPSDQ9NZQ3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NCKIPSDQ9NZQ3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NCKIPSDQ9NZQ3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NCKIPSDQ9NZQ3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NCKIPSDQ9NZQ3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NCKIPSDQ9NZQ3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NCKIPSDQ9NZQ3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NCKIPSDQ9NZQ3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NCKIPSDQ9NZQ3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NCKIPSDQ9NZQ3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NCKIPSDQ9NZQ3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCKIPSDQ9NZQ3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCKIPSDQ9NZQ3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms