Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN8

CNOT2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT2Q9NZN8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNOT2Q9NZN8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CNOT2Q9NZN8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNOT2Q9NZN8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNOT2Q9NZN8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNOT2Q9NZN8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNOT2Q9NZN8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNOT2Q9NZN8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNOT2Q9NZN8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNOT2Q9NZN8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNOT2Q9NZN8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNOT2Q9NZN8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNOT2Q9NZN8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNOT2Q9NZN8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CNOT2Q9NZN8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNOT2Q9NZN8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNOT2Q9NZN8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNOT2Q9NZN8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNOT2Q9NZN8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNOT2Q9NZN8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNOT2Q9NZN8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNOT2Q9NZN8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNOT2Q9NZN8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNOT2Q9NZN8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNOT2Q9NZN8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNOT2Q9NZN8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNOT2Q9NZN8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNOT2Q9NZN8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNOT2Q9NZN8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNOT2Q9NZN8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNOT2Q9NZN8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNOT2Q9NZN8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNOT2Q9NZN8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNOT2Q9NZN8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNOT2Q9NZN8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNOT2Q9NZN8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CNOT2Q9NZN8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNOT2Q9NZN8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNOT2Q9NZN8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNOT2Q9NZN8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CNOT2Q9NZN8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNOT2Q9NZN8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNOT2Q9NZN8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNOT2Q9NZN8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNOT2Q9NZN8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNOT2Q9NZN8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNOT2Q9NZN8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNOT2Q9NZN8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNOT2Q9NZN8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNOT2Q9NZN8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CNOT2Q9NZN8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNOT2Q9NZN8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNOT2Q9NZN8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNOT2Q9NZN8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CNOT2Q9NZN8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CNOT2Q9NZN8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNOT2Q9NZN8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNOT2Q9NZN8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNOT2Q9NZN8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNOT2Q9NZN8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNOT2Q9NZN8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CNOT2Q9NZN8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNOT2Q9NZN8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNOT2Q9NZN8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNOT2Q9NZN8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CNOT2Q9NZN8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNOT2Q9NZN8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNOT2Q9NZN8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNOT2Q9NZN8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNOT2Q9NZN8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNOT2Q9NZN8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CNOT2Q9NZN8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNOT2Q9NZN8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNOT2Q9NZN8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNOT2Q9NZN8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNOT2Q9NZN8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNOT2Q9NZN8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNOT2Q9NZN8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNOT2Q9NZN8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNOT2Q9NZN8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNOT2Q9NZN8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNOT2Q9NZN8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNOT2Q9NZN8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNOT2Q9NZN8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNOT2Q9NZN8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNOT2Q9NZN8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNOT2Q9NZN8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNOT2Q9NZN8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNOT2Q9NZN8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNOT2Q9NZN8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNOT2Q9NZN8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNOT2Q9NZN8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNOT2Q9NZN8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNOT2Q9NZN8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNOT2Q9NZN8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNOT2Q9NZN8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNOT2Q9NZN8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CNOT2Q9NZN8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNOT2Q9NZN8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNOT2Q9NZN8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms