Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY47

CACNA2D2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D2Q9NY47 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CACNA2D2Q9NY47 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CACNA2D2Q9NY47 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CACNA2D2Q9NY47 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CACNA2D2Q9NY47 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CACNA2D2Q9NY47 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CACNA2D2Q9NY47 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CACNA2D2Q9NY47 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CACNA2D2Q9NY47 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CACNA2D2Q9NY47 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CACNA2D2Q9NY47 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CACNA2D2Q9NY47 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CACNA2D2Q9NY47 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CACNA2D2Q9NY47 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CACNA2D2Q9NY47 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CACNA2D2Q9NY47 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CACNA2D2Q9NY47 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CACNA2D2Q9NY47 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CACNA2D2Q9NY47 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CACNA2D2Q9NY47 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CACNA2D2Q9NY47 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CACNA2D2Q9NY47 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CACNA2D2Q9NY47 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CACNA2D2Q9NY47 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CACNA2D2Q9NY47 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CACNA2D2Q9NY47 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CACNA2D2Q9NY47 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CACNA2D2Q9NY47 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CACNA2D2Q9NY47 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CACNA2D2Q9NY47 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CACNA2D2Q9NY47 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CACNA2D2Q9NY47 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CACNA2D2Q9NY47 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CACNA2D2Q9NY47 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CACNA2D2Q9NY47 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CACNA2D2Q9NY47 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CACNA2D2Q9NY47 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CACNA2D2Q9NY47 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CACNA2D2Q9NY47 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CACNA2D2Q9NY47 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CACNA2D2Q9NY47 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CACNA2D2Q9NY47 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CACNA2D2Q9NY47 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CACNA2D2Q9NY47 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CACNA2D2Q9NY47 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CACNA2D2Q9NY47 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CACNA2D2Q9NY47 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CACNA2D2Q9NY47 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CACNA2D2Q9NY47 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CACNA2D2Q9NY47 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CACNA2D2Q9NY47 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CACNA2D2Q9NY47 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CACNA2D2Q9NY47 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CACNA2D2Q9NY47 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CACNA2D2Q9NY47 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CACNA2D2Q9NY47 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CACNA2D2Q9NY47 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CACNA2D2Q9NY47 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CACNA2D2Q9NY47 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CACNA2D2Q9NY47 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CACNA2D2Q9NY47 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CACNA2D2Q9NY47 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CACNA2D2Q9NY47 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CACNA2D2Q9NY47 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CACNA2D2Q9NY47 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CACNA2D2Q9NY47 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CACNA2D2Q9NY47 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CACNA2D2Q9NY47 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CACNA2D2Q9NY47 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CACNA2D2Q9NY47 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CACNA2D2Q9NY47 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CACNA2D2Q9NY47 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CACNA2D2Q9NY47 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CACNA2D2Q9NY47 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CACNA2D2Q9NY47 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CACNA2D2Q9NY47 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CACNA2D2Q9NY47 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CACNA2D2Q9NY47 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CACNA2D2Q9NY47 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CACNA2D2Q9NY47 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CACNA2D2Q9NY47 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CACNA2D2Q9NY47 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CACNA2D2Q9NY47 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CACNA2D2Q9NY47 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CACNA2D2Q9NY47 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CACNA2D2Q9NY47 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CACNA2D2Q9NY47 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CACNA2D2Q9NY47 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CACNA2D2Q9NY47 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CACNA2D2Q9NY47 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CACNA2D2Q9NY47 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CACNA2D2Q9NY47 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CACNA2D2Q9NY47 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CACNA2D2Q9NY47 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CACNA2D2Q9NY47 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CACNA2D2Q9NY47 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CACNA2D2Q9NY47 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CACNA2D2Q9NY47 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CACNA2D2Q9NY47 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CACNA2D2Q9NY47 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms