Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH9

TRMT1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT1Q9NXH9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRMT1Q9NXH9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRMT1Q9NXH9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRMT1Q9NXH9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRMT1Q9NXH9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRMT1Q9NXH9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRMT1Q9NXH9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRMT1Q9NXH9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TRMT1Q9NXH9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRMT1Q9NXH9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRMT1Q9NXH9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRMT1Q9NXH9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRMT1Q9NXH9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRMT1Q9NXH9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRMT1Q9NXH9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRMT1Q9NXH9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TRMT1Q9NXH9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
TRMT1Q9NXH9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TRMT1Q9NXH9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRMT1Q9NXH9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRMT1Q9NXH9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRMT1Q9NXH9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRMT1Q9NXH9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRMT1Q9NXH9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRMT1Q9NXH9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRMT1Q9NXH9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRMT1Q9NXH9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRMT1Q9NXH9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRMT1Q9NXH9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRMT1Q9NXH9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRMT1Q9NXH9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRMT1Q9NXH9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRMT1Q9NXH9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRMT1Q9NXH9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRMT1Q9NXH9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRMT1Q9NXH9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRMT1Q9NXH9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRMT1Q9NXH9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRMT1Q9NXH9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRMT1Q9NXH9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRMT1Q9NXH9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRMT1Q9NXH9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRMT1Q9NXH9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRMT1Q9NXH9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRMT1Q9NXH9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRMT1Q9NXH9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRMT1Q9NXH9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRMT1Q9NXH9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRMT1Q9NXH9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRMT1Q9NXH9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRMT1Q9NXH9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRMT1Q9NXH9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TRMT1Q9NXH9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRMT1Q9NXH9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRMT1Q9NXH9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRMT1Q9NXH9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRMT1Q9NXH9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRMT1Q9NXH9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRMT1Q9NXH9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRMT1Q9NXH9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRMT1Q9NXH9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRMT1Q9NXH9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRMT1Q9NXH9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TRMT1Q9NXH9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TRMT1Q9NXH9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TRMT1Q9NXH9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TRMT1Q9NXH9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TRMT1Q9NXH9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRMT1Q9NXH9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRMT1Q9NXH9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRMT1Q9NXH9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRMT1Q9NXH9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRMT1Q9NXH9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRMT1Q9NXH9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRMT1Q9NXH9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRMT1Q9NXH9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRMT1Q9NXH9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRMT1Q9NXH9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRMT1Q9NXH9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRMT1Q9NXH9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRMT1Q9NXH9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRMT1Q9NXH9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRMT1Q9NXH9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRMT1Q9NXH9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TRMT1Q9NXH9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRMT1Q9NXH9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRMT1Q9NXH9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRMT1Q9NXH9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRMT1Q9NXH9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
TRMT1Q9NXH9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
TRMT1Q9NXH9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRMT1Q9NXH9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRMT1Q9NXH9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRMT1Q9NXH9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRMT1Q9NXH9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRMT1Q9NXH9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRMT1Q9NXH9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRMT1Q9NXH9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRMT1Q9NXH9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRMT1Q9NXH9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms