Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWF4

SLC52A1, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 1, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A1Q9NWF4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
SLC52A1Q9NWF4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
SLC52A1Q9NWF4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
SLC52A1Q9NWF4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
SLC52A1Q9NWF4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
SLC52A1Q9NWF4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC36.53■■■■□ 3.44
SLC52A1Q9NWF4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
SLC52A1Q9NWF4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC36.52■■■■□ 3.44
SLC52A1Q9NWF4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
SLC52A1Q9NWF4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
SLC52A1Q9NWF4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
SLC52A1Q9NWF4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
SLC52A1Q9NWF4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.44
SLC52A1Q9NWF4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
SLC52A1Q9NWF4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
SLC52A1Q9NWF4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
SLC52A1Q9NWF4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
SLC52A1Q9NWF4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
SLC52A1Q9NWF4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
SLC52A1Q9NWF4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
SLC52A1Q9NWF4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
SLC52A1Q9NWF4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
SLC52A1Q9NWF4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
SLC52A1Q9NWF4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
SLC52A1Q9NWF4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
SLC52A1Q9NWF4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
SLC52A1Q9NWF4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
SLC52A1Q9NWF4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
SLC52A1Q9NWF4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
SLC52A1Q9NWF4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
SLC52A1Q9NWF4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
SLC52A1Q9NWF4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
SLC52A1Q9NWF4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
SLC52A1Q9NWF4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
SLC52A1Q9NWF4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
SLC52A1Q9NWF4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
SLC52A1Q9NWF4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
SLC52A1Q9NWF4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
SLC52A1Q9NWF4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
SLC52A1Q9NWF4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
SLC52A1Q9NWF4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
SLC52A1Q9NWF4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
SLC52A1Q9NWF4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
SLC52A1Q9NWF4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
SLC52A1Q9NWF4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
SLC52A1Q9NWF4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
SLC52A1Q9NWF4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
SLC52A1Q9NWF4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
SLC52A1Q9NWF4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC36.37■■■■□ 3.41
SLC52A1Q9NWF4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
SLC52A1Q9NWF4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
SLC52A1Q9NWF4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
SLC52A1Q9NWF4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
SLC52A1Q9NWF4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
SLC52A1Q9NWF4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
SLC52A1Q9NWF4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
SLC52A1Q9NWF4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
SLC52A1Q9NWF4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
SLC52A1Q9NWF4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
SLC52A1Q9NWF4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
SLC52A1Q9NWF4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
SLC52A1Q9NWF4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC36.33■■■■□ 3.41
SLC52A1Q9NWF4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
SLC52A1Q9NWF4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
SLC52A1Q9NWF4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
SLC52A1Q9NWF4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
SLC52A1Q9NWF4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
SLC52A1Q9NWF4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC36.31■■■■□ 3.4
SLC52A1Q9NWF4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
SLC52A1Q9NWF4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
SLC52A1Q9NWF4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
SLC52A1Q9NWF4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
SLC52A1Q9NWF4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
SLC52A1Q9NWF4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
SLC52A1Q9NWF4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
SLC52A1Q9NWF4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
SLC52A1Q9NWF4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
SLC52A1Q9NWF4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
SLC52A1Q9NWF4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
SLC52A1Q9NWF4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
SLC52A1Q9NWF4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
SLC52A1Q9NWF4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
SLC52A1Q9NWF4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
SLC52A1Q9NWF4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
SLC52A1Q9NWF4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
SLC52A1Q9NWF4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
SLC52A1Q9NWF4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
SLC52A1Q9NWF4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
SLC52A1Q9NWF4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
SLC52A1Q9NWF4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
SLC52A1Q9NWF4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
SLC52A1Q9NWF4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
SLC52A1Q9NWF4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
SLC52A1Q9NWF4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
SLC52A1Q9NWF4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
SLC52A1Q9NWF4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
SLC52A1Q9NWF4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
SLC52A1Q9NWF4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
SLC52A1Q9NWF4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
SLC52A1Q9NWF4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.2 ms