Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD4

ZNF275, Zinc finger protein 275, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF275Q9NSD4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF275Q9NSD4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF275Q9NSD4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF275Q9NSD4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF275Q9NSD4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF275Q9NSD4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF275Q9NSD4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF275Q9NSD4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF275Q9NSD4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF275Q9NSD4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF275Q9NSD4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF275Q9NSD4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF275Q9NSD4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF275Q9NSD4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF275Q9NSD4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF275Q9NSD4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF275Q9NSD4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF275Q9NSD4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF275Q9NSD4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF275Q9NSD4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF275Q9NSD4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF275Q9NSD4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF275Q9NSD4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF275Q9NSD4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF275Q9NSD4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF275Q9NSD4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF275Q9NSD4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF275Q9NSD4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF275Q9NSD4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF275Q9NSD4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF275Q9NSD4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF275Q9NSD4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF275Q9NSD4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF275Q9NSD4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF275Q9NSD4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF275Q9NSD4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF275Q9NSD4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF275Q9NSD4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF275Q9NSD4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF275Q9NSD4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF275Q9NSD4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF275Q9NSD4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF275Q9NSD4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF275Q9NSD4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF275Q9NSD4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF275Q9NSD4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF275Q9NSD4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF275Q9NSD4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF275Q9NSD4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF275Q9NSD4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF275Q9NSD4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF275Q9NSD4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF275Q9NSD4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF275Q9NSD4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF275Q9NSD4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF275Q9NSD4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF275Q9NSD4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZNF275Q9NSD4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF275Q9NSD4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF275Q9NSD4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF275Q9NSD4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF275Q9NSD4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF275Q9NSD4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF275Q9NSD4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF275Q9NSD4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF275Q9NSD4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF275Q9NSD4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF275Q9NSD4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF275Q9NSD4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF275Q9NSD4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF275Q9NSD4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF275Q9NSD4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF275Q9NSD4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF275Q9NSD4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF275Q9NSD4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF275Q9NSD4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF275Q9NSD4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF275Q9NSD4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF275Q9NSD4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF275Q9NSD4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF275Q9NSD4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF275Q9NSD4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF275Q9NSD4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF275Q9NSD4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF275Q9NSD4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF275Q9NSD4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF275Q9NSD4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF275Q9NSD4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF275Q9NSD4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF275Q9NSD4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF275Q9NSD4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF275Q9NSD4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF275Q9NSD4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF275Q9NSD4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF275Q9NSD4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF275Q9NSD4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF275Q9NSD4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF275Q9NSD4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF275Q9NSD4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF275Q9NSD4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms