Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP59

SLC40A1, Solute carrier family 40 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC40A1Q9NP59 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC40A1Q9NP59 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC40A1Q9NP59 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC40A1Q9NP59 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC40A1Q9NP59 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC40A1Q9NP59 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC40A1Q9NP59 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC40A1Q9NP59 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC40A1Q9NP59 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC40A1Q9NP59 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC40A1Q9NP59 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC40A1Q9NP59 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC40A1Q9NP59 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC40A1Q9NP59 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC40A1Q9NP59 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC40A1Q9NP59 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC40A1Q9NP59 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC40A1Q9NP59 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC40A1Q9NP59 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC40A1Q9NP59 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC40A1Q9NP59 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC40A1Q9NP59 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC40A1Q9NP59 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC40A1Q9NP59 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC40A1Q9NP59 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC40A1Q9NP59 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC40A1Q9NP59 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC40A1Q9NP59 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC40A1Q9NP59 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC40A1Q9NP59 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC40A1Q9NP59 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC40A1Q9NP59 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC40A1Q9NP59 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC40A1Q9NP59 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC40A1Q9NP59 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC40A1Q9NP59 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC40A1Q9NP59 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC40A1Q9NP59 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC40A1Q9NP59 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC40A1Q9NP59 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC40A1Q9NP59 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC40A1Q9NP59 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC40A1Q9NP59 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC40A1Q9NP59 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC40A1Q9NP59 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC40A1Q9NP59 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC40A1Q9NP59 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC40A1Q9NP59 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC40A1Q9NP59 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC40A1Q9NP59 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC40A1Q9NP59 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SLC40A1Q9NP59 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC40A1Q9NP59 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC40A1Q9NP59 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC40A1Q9NP59 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC40A1Q9NP59 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC40A1Q9NP59 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC40A1Q9NP59 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC40A1Q9NP59 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC40A1Q9NP59 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC40A1Q9NP59 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC40A1Q9NP59 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC40A1Q9NP59 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC40A1Q9NP59 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC40A1Q9NP59 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC40A1Q9NP59 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC40A1Q9NP59 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC40A1Q9NP59 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC40A1Q9NP59 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC40A1Q9NP59 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC40A1Q9NP59 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC40A1Q9NP59 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC40A1Q9NP59 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC40A1Q9NP59 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC40A1Q9NP59 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC40A1Q9NP59 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC40A1Q9NP59 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC40A1Q9NP59 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC40A1Q9NP59 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC40A1Q9NP59 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC40A1Q9NP59 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC40A1Q9NP59 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC40A1Q9NP59 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC40A1Q9NP59 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC40A1Q9NP59 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC40A1Q9NP59 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC40A1Q9NP59 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC40A1Q9NP59 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC40A1Q9NP59 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC40A1Q9NP59 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC40A1Q9NP59 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC40A1Q9NP59 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC40A1Q9NP59 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC40A1Q9NP59 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC40A1Q9NP59 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC40A1Q9NP59 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC40A1Q9NP59 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC40A1Q9NP59 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC40A1Q9NP59 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC40A1Q9NP59 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms