Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ERVK-5Q9HDB9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ERVK-5Q9HDB9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ERVK-5Q9HDB9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ERVK-5Q9HDB9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ERVK-5Q9HDB9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ERVK-5Q9HDB9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ERVK-5Q9HDB9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ERVK-5Q9HDB9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ERVK-5Q9HDB9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ERVK-5Q9HDB9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ERVK-5Q9HDB9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ERVK-5Q9HDB9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ERVK-5Q9HDB9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ERVK-5Q9HDB9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ERVK-5Q9HDB9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
ERVK-5Q9HDB9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
ERVK-5Q9HDB9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
ERVK-5Q9HDB9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ERVK-5Q9HDB9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ERVK-5Q9HDB9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ERVK-5Q9HDB9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ERVK-5Q9HDB9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ERVK-5Q9HDB9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
ERVK-5Q9HDB9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ERVK-5Q9HDB9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ERVK-5Q9HDB9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ERVK-5Q9HDB9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ERVK-5Q9HDB9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ERVK-5Q9HDB9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ERVK-5Q9HDB9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
ERVK-5Q9HDB9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ERVK-5Q9HDB9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ERVK-5Q9HDB9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ERVK-5Q9HDB9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ERVK-5Q9HDB9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ERVK-5Q9HDB9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ERVK-5Q9HDB9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
ERVK-5Q9HDB9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ERVK-5Q9HDB9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ERVK-5Q9HDB9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
ERVK-5Q9HDB9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ERVK-5Q9HDB9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
ERVK-5Q9HDB9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ERVK-5Q9HDB9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ERVK-5Q9HDB9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ERVK-5Q9HDB9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ERVK-5Q9HDB9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
ERVK-5Q9HDB9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ERVK-5Q9HDB9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ERVK-5Q9HDB9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ERVK-5Q9HDB9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ERVK-5Q9HDB9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ERVK-5Q9HDB9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ERVK-5Q9HDB9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ERVK-5Q9HDB9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
ERVK-5Q9HDB9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ERVK-5Q9HDB9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ERVK-5Q9HDB9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ERVK-5Q9HDB9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ERVK-5Q9HDB9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ERVK-5Q9HDB9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ERVK-5Q9HDB9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ERVK-5Q9HDB9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ERVK-5Q9HDB9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ERVK-5Q9HDB9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ERVK-5Q9HDB9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ERVK-5Q9HDB9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ERVK-5Q9HDB9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ERVK-5Q9HDB9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ERVK-5Q9HDB9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ERVK-5Q9HDB9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ERVK-5Q9HDB9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ERVK-5Q9HDB9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ERVK-5Q9HDB9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ERVK-5Q9HDB9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ERVK-5Q9HDB9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
ERVK-5Q9HDB9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ERVK-5Q9HDB9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
ERVK-5Q9HDB9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ERVK-5Q9HDB9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ERVK-5Q9HDB9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ERVK-5Q9HDB9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ERVK-5Q9HDB9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ERVK-5Q9HDB9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ERVK-5Q9HDB9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ERVK-5Q9HDB9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
ERVK-5Q9HDB9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ERVK-5Q9HDB9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ERVK-5Q9HDB9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ERVK-5Q9HDB9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ERVK-5Q9HDB9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ERVK-5Q9HDB9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ERVK-5Q9HDB9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ERVK-5Q9HDB9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ERVK-5Q9HDB9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ERVK-5Q9HDB9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ERVK-5Q9HDB9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ERVK-5Q9HDB9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ERVK-5Q9HDB9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms