Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCC0

MCCC2, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCC2Q9HCC0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCCC2Q9HCC0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCCC2Q9HCC0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCCC2Q9HCC0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCCC2Q9HCC0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCCC2Q9HCC0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCCC2Q9HCC0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MCCC2Q9HCC0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCCC2Q9HCC0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCCC2Q9HCC0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCCC2Q9HCC0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCCC2Q9HCC0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCCC2Q9HCC0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCCC2Q9HCC0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCCC2Q9HCC0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCCC2Q9HCC0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCCC2Q9HCC0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCCC2Q9HCC0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCCC2Q9HCC0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCCC2Q9HCC0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCCC2Q9HCC0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCCC2Q9HCC0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCCC2Q9HCC0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCCC2Q9HCC0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCCC2Q9HCC0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCCC2Q9HCC0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCCC2Q9HCC0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCCC2Q9HCC0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MCCC2Q9HCC0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCCC2Q9HCC0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCCC2Q9HCC0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCCC2Q9HCC0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCCC2Q9HCC0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCCC2Q9HCC0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MCCC2Q9HCC0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MCCC2Q9HCC0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MCCC2Q9HCC0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MCCC2Q9HCC0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MCCC2Q9HCC0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCCC2Q9HCC0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCCC2Q9HCC0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCCC2Q9HCC0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCCC2Q9HCC0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCCC2Q9HCC0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCCC2Q9HCC0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MCCC2Q9HCC0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCCC2Q9HCC0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCCC2Q9HCC0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MCCC2Q9HCC0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCCC2Q9HCC0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MCCC2Q9HCC0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCCC2Q9HCC0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCCC2Q9HCC0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCCC2Q9HCC0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCCC2Q9HCC0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCCC2Q9HCC0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCCC2Q9HCC0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCCC2Q9HCC0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCCC2Q9HCC0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCCC2Q9HCC0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCCC2Q9HCC0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCCC2Q9HCC0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCCC2Q9HCC0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCCC2Q9HCC0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCCC2Q9HCC0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MCCC2Q9HCC0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCCC2Q9HCC0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCCC2Q9HCC0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCCC2Q9HCC0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCCC2Q9HCC0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCCC2Q9HCC0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCCC2Q9HCC0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCCC2Q9HCC0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCCC2Q9HCC0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MCCC2Q9HCC0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCCC2Q9HCC0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCCC2Q9HCC0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCCC2Q9HCC0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCCC2Q9HCC0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCCC2Q9HCC0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCCC2Q9HCC0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCCC2Q9HCC0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCCC2Q9HCC0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCCC2Q9HCC0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCCC2Q9HCC0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCCC2Q9HCC0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCCC2Q9HCC0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCCC2Q9HCC0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCCC2Q9HCC0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCCC2Q9HCC0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCCC2Q9HCC0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCCC2Q9HCC0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCCC2Q9HCC0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCCC2Q9HCC0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCCC2Q9HCC0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCCC2Q9HCC0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCCC2Q9HCC0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCCC2Q9HCC0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCCC2Q9HCC0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCCC2Q9HCC0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms