Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU4

SMURF2, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF2, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF2Q9HAU4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMURF2Q9HAU4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMURF2Q9HAU4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMURF2Q9HAU4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMURF2Q9HAU4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMURF2Q9HAU4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMURF2Q9HAU4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SMURF2Q9HAU4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SMURF2Q9HAU4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMURF2Q9HAU4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMURF2Q9HAU4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMURF2Q9HAU4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMURF2Q9HAU4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMURF2Q9HAU4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMURF2Q9HAU4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMURF2Q9HAU4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMURF2Q9HAU4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMURF2Q9HAU4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMURF2Q9HAU4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMURF2Q9HAU4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SMURF2Q9HAU4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMURF2Q9HAU4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMURF2Q9HAU4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMURF2Q9HAU4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMURF2Q9HAU4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMURF2Q9HAU4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMURF2Q9HAU4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMURF2Q9HAU4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMURF2Q9HAU4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SMURF2Q9HAU4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMURF2Q9HAU4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SMURF2Q9HAU4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMURF2Q9HAU4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMURF2Q9HAU4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMURF2Q9HAU4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMURF2Q9HAU4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMURF2Q9HAU4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMURF2Q9HAU4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SMURF2Q9HAU4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMURF2Q9HAU4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMURF2Q9HAU4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SMURF2Q9HAU4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMURF2Q9HAU4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SMURF2Q9HAU4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMURF2Q9HAU4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMURF2Q9HAU4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMURF2Q9HAU4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMURF2Q9HAU4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMURF2Q9HAU4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMURF2Q9HAU4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMURF2Q9HAU4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMURF2Q9HAU4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMURF2Q9HAU4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMURF2Q9HAU4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMURF2Q9HAU4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMURF2Q9HAU4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMURF2Q9HAU4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMURF2Q9HAU4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMURF2Q9HAU4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SMURF2Q9HAU4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMURF2Q9HAU4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMURF2Q9HAU4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMURF2Q9HAU4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMURF2Q9HAU4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMURF2Q9HAU4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMURF2Q9HAU4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMURF2Q9HAU4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMURF2Q9HAU4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMURF2Q9HAU4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMURF2Q9HAU4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMURF2Q9HAU4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMURF2Q9HAU4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMURF2Q9HAU4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMURF2Q9HAU4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMURF2Q9HAU4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMURF2Q9HAU4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMURF2Q9HAU4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SMURF2Q9HAU4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
SMURF2Q9HAU4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SMURF2Q9HAU4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMURF2Q9HAU4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMURF2Q9HAU4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SMURF2Q9HAU4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMURF2Q9HAU4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMURF2Q9HAU4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMURF2Q9HAU4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMURF2Q9HAU4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMURF2Q9HAU4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMURF2Q9HAU4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMURF2Q9HAU4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMURF2Q9HAU4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMURF2Q9HAU4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SMURF2Q9HAU4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMURF2Q9HAU4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMURF2Q9HAU4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMURF2Q9HAU4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMURF2Q9HAU4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMURF2Q9HAU4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMURF2Q9HAU4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMURF2Q9HAU4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms