Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SSBP4Q9BWG4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSBP4Q9BWG4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SSBP4Q9BWG4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSBP4Q9BWG4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSBP4Q9BWG4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSBP4Q9BWG4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSBP4Q9BWG4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSBP4Q9BWG4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SSBP4Q9BWG4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SSBP4Q9BWG4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SSBP4Q9BWG4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SSBP4Q9BWG4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SSBP4Q9BWG4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SSBP4Q9BWG4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SSBP4Q9BWG4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SSBP4Q9BWG4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSBP4Q9BWG4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSBP4Q9BWG4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SSBP4Q9BWG4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSBP4Q9BWG4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSBP4Q9BWG4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSBP4Q9BWG4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSBP4Q9BWG4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSBP4Q9BWG4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSBP4Q9BWG4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSBP4Q9BWG4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSBP4Q9BWG4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSBP4Q9BWG4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSBP4Q9BWG4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSBP4Q9BWG4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SSBP4Q9BWG4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SSBP4Q9BWG4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SSBP4Q9BWG4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SSBP4Q9BWG4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSBP4Q9BWG4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSBP4Q9BWG4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSBP4Q9BWG4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSBP4Q9BWG4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSBP4Q9BWG4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSBP4Q9BWG4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSBP4Q9BWG4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSBP4Q9BWG4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSBP4Q9BWG4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSBP4Q9BWG4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSBP4Q9BWG4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSBP4Q9BWG4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSBP4Q9BWG4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSBP4Q9BWG4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSBP4Q9BWG4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSBP4Q9BWG4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSBP4Q9BWG4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSBP4Q9BWG4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSBP4Q9BWG4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSBP4Q9BWG4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSBP4Q9BWG4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSBP4Q9BWG4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSBP4Q9BWG4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSBP4Q9BWG4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSBP4Q9BWG4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSBP4Q9BWG4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSBP4Q9BWG4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSBP4Q9BWG4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSBP4Q9BWG4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SSBP4Q9BWG4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSBP4Q9BWG4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SSBP4Q9BWG4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSBP4Q9BWG4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSBP4Q9BWG4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSBP4Q9BWG4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSBP4Q9BWG4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSBP4Q9BWG4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSBP4Q9BWG4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SSBP4Q9BWG4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SSBP4Q9BWG4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SSBP4Q9BWG4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SSBP4Q9BWG4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SSBP4Q9BWG4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSBP4Q9BWG4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSBP4Q9BWG4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSBP4Q9BWG4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SSBP4Q9BWG4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSBP4Q9BWG4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SSBP4Q9BWG4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSBP4Q9BWG4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSBP4Q9BWG4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSBP4Q9BWG4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SSBP4Q9BWG4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSBP4Q9BWG4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSBP4Q9BWG4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSBP4Q9BWG4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSBP4Q9BWG4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSBP4Q9BWG4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSBP4Q9BWG4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSBP4Q9BWG4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSBP4Q9BWG4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSBP4Q9BWG4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSBP4Q9BWG4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSBP4Q9BWG4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSBP4Q9BWG4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms