Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RTKNQ9BST9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RTKNQ9BST9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RTKNQ9BST9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RTKNQ9BST9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RTKNQ9BST9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RTKNQ9BST9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RTKNQ9BST9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RTKNQ9BST9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RTKNQ9BST9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RTKNQ9BST9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RTKNQ9BST9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RTKNQ9BST9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RTKNQ9BST9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RTKNQ9BST9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RTKNQ9BST9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RTKNQ9BST9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RTKNQ9BST9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RTKNQ9BST9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RTKNQ9BST9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RTKNQ9BST9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RTKNQ9BST9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RTKNQ9BST9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RTKNQ9BST9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RTKNQ9BST9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RTKNQ9BST9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RTKNQ9BST9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RTKNQ9BST9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RTKNQ9BST9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RTKNQ9BST9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RTKNQ9BST9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RTKNQ9BST9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RTKNQ9BST9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RTKNQ9BST9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RTKNQ9BST9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RTKNQ9BST9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RTKNQ9BST9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RTKNQ9BST9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RTKNQ9BST9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RTKNQ9BST9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RTKNQ9BST9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RTKNQ9BST9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RTKNQ9BST9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RTKNQ9BST9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RTKNQ9BST9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RTKNQ9BST9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RTKNQ9BST9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RTKNQ9BST9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RTKNQ9BST9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RTKNQ9BST9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RTKNQ9BST9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RTKNQ9BST9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RTKNQ9BST9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RTKNQ9BST9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RTKNQ9BST9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RTKNQ9BST9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RTKNQ9BST9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RTKNQ9BST9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RTKNQ9BST9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RTKNQ9BST9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RTKNQ9BST9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RTKNQ9BST9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTKNQ9BST9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTKNQ9BST9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RTKNQ9BST9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTKNQ9BST9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RTKNQ9BST9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RTKNQ9BST9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RTKNQ9BST9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RTKNQ9BST9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RTKNQ9BST9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RTKNQ9BST9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RTKNQ9BST9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RTKNQ9BST9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RTKNQ9BST9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RTKNQ9BST9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RTKNQ9BST9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RTKNQ9BST9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RTKNQ9BST9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RTKNQ9BST9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RTKNQ9BST9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RTKNQ9BST9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RTKNQ9BST9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RTKNQ9BST9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RTKNQ9BST9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RTKNQ9BST9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RTKNQ9BST9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RTKNQ9BST9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RTKNQ9BST9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RTKNQ9BST9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RTKNQ9BST9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RTKNQ9BST9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RTKNQ9BST9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RTKNQ9BST9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RTKNQ9BST9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RTKNQ9BST9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RTKNQ9BST9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RTKNQ9BST9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RTKNQ9BST9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RTKNQ9BST9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms