Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GINS3Q9BRX5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GINS3Q9BRX5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GINS3Q9BRX5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
GINS3Q9BRX5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GINS3Q9BRX5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GINS3Q9BRX5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GINS3Q9BRX5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GINS3Q9BRX5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GINS3Q9BRX5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GINS3Q9BRX5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GINS3Q9BRX5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GINS3Q9BRX5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GINS3Q9BRX5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GINS3Q9BRX5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GINS3Q9BRX5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GINS3Q9BRX5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GINS3Q9BRX5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GINS3Q9BRX5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GINS3Q9BRX5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GINS3Q9BRX5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GINS3Q9BRX5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GINS3Q9BRX5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GINS3Q9BRX5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GINS3Q9BRX5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GINS3Q9BRX5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GINS3Q9BRX5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GINS3Q9BRX5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GINS3Q9BRX5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GINS3Q9BRX5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GINS3Q9BRX5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GINS3Q9BRX5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GINS3Q9BRX5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GINS3Q9BRX5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GINS3Q9BRX5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GINS3Q9BRX5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GINS3Q9BRX5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GINS3Q9BRX5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GINS3Q9BRX5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GINS3Q9BRX5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GINS3Q9BRX5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GINS3Q9BRX5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GINS3Q9BRX5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GINS3Q9BRX5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GINS3Q9BRX5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GINS3Q9BRX5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GINS3Q9BRX5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GINS3Q9BRX5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GINS3Q9BRX5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GINS3Q9BRX5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GINS3Q9BRX5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GINS3Q9BRX5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GINS3Q9BRX5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GINS3Q9BRX5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GINS3Q9BRX5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GINS3Q9BRX5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GINS3Q9BRX5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GINS3Q9BRX5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GINS3Q9BRX5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GINS3Q9BRX5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GINS3Q9BRX5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GINS3Q9BRX5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GINS3Q9BRX5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GINS3Q9BRX5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GINS3Q9BRX5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GINS3Q9BRX5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GINS3Q9BRX5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GINS3Q9BRX5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GINS3Q9BRX5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GINS3Q9BRX5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GINS3Q9BRX5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GINS3Q9BRX5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GINS3Q9BRX5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GINS3Q9BRX5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GINS3Q9BRX5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GINS3Q9BRX5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GINS3Q9BRX5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GINS3Q9BRX5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GINS3Q9BRX5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GINS3Q9BRX5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GINS3Q9BRX5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GINS3Q9BRX5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GINS3Q9BRX5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GINS3Q9BRX5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GINS3Q9BRX5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GINS3Q9BRX5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GINS3Q9BRX5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GINS3Q9BRX5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GINS3Q9BRX5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GINS3Q9BRX5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GINS3Q9BRX5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GINS3Q9BRX5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GINS3Q9BRX5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GINS3Q9BRX5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GINS3Q9BRX5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GINS3Q9BRX5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GINS3Q9BRX5 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GINS3Q9BRX5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GINS3Q9BRX5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GINS3Q9BRX5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms