Protein–RNA interactions for Protein: Q99952

PTPN18, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 18, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN18Q99952 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPN18Q99952 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPN18Q99952 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPN18Q99952 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPN18Q99952 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPN18Q99952 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPN18Q99952 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPN18Q99952 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPN18Q99952 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPN18Q99952 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPN18Q99952 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTPN18Q99952 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTPN18Q99952 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
PTPN18Q99952 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTPN18Q99952 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTPN18Q99952 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTPN18Q99952 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTPN18Q99952 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTPN18Q99952 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTPN18Q99952 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
PTPN18Q99952 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPN18Q99952 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPN18Q99952 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPN18Q99952 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPN18Q99952 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPN18Q99952 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPN18Q99952 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPN18Q99952 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPN18Q99952 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTPN18Q99952 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTPN18Q99952 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
PTPN18Q99952 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PTPN18Q99952 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PTPN18Q99952 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PTPN18Q99952 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PTPN18Q99952 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPN18Q99952 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPN18Q99952 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPN18Q99952 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPN18Q99952 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPN18Q99952 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPN18Q99952 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPN18Q99952 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTPN18Q99952 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
PTPN18Q99952 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTPN18Q99952 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPN18Q99952 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPN18Q99952 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPN18Q99952 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPN18Q99952 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPN18Q99952 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPN18Q99952 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPN18Q99952 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
PTPN18Q99952 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTPN18Q99952 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTPN18Q99952 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTPN18Q99952 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTPN18Q99952 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTPN18Q99952 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
PTPN18Q99952 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTPN18Q99952 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTPN18Q99952 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PTPN18Q99952 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PTPN18Q99952 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PTPN18Q99952 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
PTPN18Q99952 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTPN18Q99952 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
PTPN18Q99952 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTPN18Q99952 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTPN18Q99952 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTPN18Q99952 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPN18Q99952 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPN18Q99952 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPN18Q99952 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPN18Q99952 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPN18Q99952 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPN18Q99952 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPN18Q99952 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPN18Q99952 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPN18Q99952 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPN18Q99952 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPN18Q99952 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPN18Q99952 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPN18Q99952 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPN18Q99952 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPN18Q99952 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPN18Q99952 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPN18Q99952 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPN18Q99952 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPN18Q99952 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPN18Q99952 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPN18Q99952 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPN18Q99952 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPN18Q99952 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPN18Q99952 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPN18Q99952 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPN18Q99952 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTPN18Q99952 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTPN18Q99952 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTPN18Q99952 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms