Protein–RNA interactions for Protein: Q99808

SLC29A1, Equilibrative nucleoside transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC29A1Q99808 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC29A1Q99808 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC29A1Q99808 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC29A1Q99808 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC29A1Q99808 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC29A1Q99808 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC29A1Q99808 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC29A1Q99808 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC29A1Q99808 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC29A1Q99808 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC29A1Q99808 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC29A1Q99808 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC29A1Q99808 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC29A1Q99808 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC29A1Q99808 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC29A1Q99808 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC29A1Q99808 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC29A1Q99808 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC29A1Q99808 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC29A1Q99808 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC29A1Q99808 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC29A1Q99808 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC29A1Q99808 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC29A1Q99808 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC29A1Q99808 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC29A1Q99808 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC29A1Q99808 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC29A1Q99808 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC29A1Q99808 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC29A1Q99808 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC29A1Q99808 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC29A1Q99808 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC29A1Q99808 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC29A1Q99808 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC29A1Q99808 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC29A1Q99808 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC29A1Q99808 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC29A1Q99808 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC29A1Q99808 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC29A1Q99808 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC29A1Q99808 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC29A1Q99808 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC29A1Q99808 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC29A1Q99808 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC29A1Q99808 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC29A1Q99808 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC29A1Q99808 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC29A1Q99808 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC29A1Q99808 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC29A1Q99808 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC29A1Q99808 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC29A1Q99808 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC29A1Q99808 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC29A1Q99808 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC29A1Q99808 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC29A1Q99808 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC29A1Q99808 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC29A1Q99808 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC29A1Q99808 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC29A1Q99808 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC29A1Q99808 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC29A1Q99808 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC29A1Q99808 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC29A1Q99808 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC29A1Q99808 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC29A1Q99808 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC29A1Q99808 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC29A1Q99808 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC29A1Q99808 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC29A1Q99808 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC29A1Q99808 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC29A1Q99808 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC29A1Q99808 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC29A1Q99808 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC29A1Q99808 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC29A1Q99808 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC29A1Q99808 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC29A1Q99808 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC29A1Q99808 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC29A1Q99808 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC29A1Q99808 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC29A1Q99808 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC29A1Q99808 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC29A1Q99808 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC29A1Q99808 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC29A1Q99808 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC29A1Q99808 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC29A1Q99808 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC29A1Q99808 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC29A1Q99808 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC29A1Q99808 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC29A1Q99808 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC29A1Q99808 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC29A1Q99808 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC29A1Q99808 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC29A1Q99808 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC29A1Q99808 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC29A1Q99808 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC29A1Q99808 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC29A1Q99808 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms