Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
PIK3R4Q99570 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
PIK3R4Q99570 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
PIK3R4Q99570 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
PIK3R4Q99570 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
PIK3R4Q99570 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
PIK3R4Q99570 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC35.66■■■■□ 3.3
PIK3R4Q99570 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
PIK3R4Q99570 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
PIK3R4Q99570 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
PIK3R4Q99570 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
PIK3R4Q99570 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
PIK3R4Q99570 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
PIK3R4Q99570 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
PIK3R4Q99570 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
PIK3R4Q99570 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
PIK3R4Q99570 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
PIK3R4Q99570 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
PIK3R4Q99570 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
PIK3R4Q99570 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
PIK3R4Q99570 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
PIK3R4Q99570 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
PIK3R4Q99570 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
PIK3R4Q99570 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC35.61■■■■□ 3.29
PIK3R4Q99570 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
PIK3R4Q99570 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
PIK3R4Q99570 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
PIK3R4Q99570 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
PIK3R4Q99570 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
PIK3R4Q99570 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
PIK3R4Q99570 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
PIK3R4Q99570 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
PIK3R4Q99570 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
PIK3R4Q99570 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
PIK3R4Q99570 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
PIK3R4Q99570 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
PIK3R4Q99570 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
PIK3R4Q99570 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
PIK3R4Q99570 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC35.57■■■■□ 3.28
PIK3R4Q99570 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
PIK3R4Q99570 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
PIK3R4Q99570 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
PIK3R4Q99570 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
PIK3R4Q99570 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
PIK3R4Q99570 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
PIK3R4Q99570 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
PIK3R4Q99570 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
PIK3R4Q99570 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC35.54■■■■□ 3.28
PIK3R4Q99570 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
PIK3R4Q99570 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
PIK3R4Q99570 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
PIK3R4Q99570 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
PIK3R4Q99570 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
PIK3R4Q99570 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
PIK3R4Q99570 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
PIK3R4Q99570 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
PIK3R4Q99570 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
PIK3R4Q99570 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
PIK3R4Q99570 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
PIK3R4Q99570 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
PIK3R4Q99570 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
PIK3R4Q99570 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
PIK3R4Q99570 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.27
PIK3R4Q99570 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC35.51■■■■□ 3.27
PIK3R4Q99570 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC35.51■■■■□ 3.27
PIK3R4Q99570 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
PIK3R4Q99570 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
PIK3R4Q99570 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
PIK3R4Q99570 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
PIK3R4Q99570 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
PIK3R4Q99570 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
PIK3R4Q99570 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
PIK3R4Q99570 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.49■■■■□ 3.27
PIK3R4Q99570 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
PIK3R4Q99570 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
PIK3R4Q99570 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
PIK3R4Q99570 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
PIK3R4Q99570 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.48■■■■□ 3.27
PIK3R4Q99570 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
PIK3R4Q99570 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
PIK3R4Q99570 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
PIK3R4Q99570 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
PIK3R4Q99570 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
PIK3R4Q99570 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
PIK3R4Q99570 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
PIK3R4Q99570 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
PIK3R4Q99570 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
PIK3R4Q99570 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
PIK3R4Q99570 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
PIK3R4Q99570 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
PIK3R4Q99570 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
PIK3R4Q99570 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.26
PIK3R4Q99570 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
PIK3R4Q99570 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
PIK3R4Q99570 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
PIK3R4Q99570 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
PIK3R4Q99570 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
PIK3R4Q99570 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
PIK3R4Q99570 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
PIK3R4Q99570 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms