Protein–RNA interactions for Protein: Q99456

KRT12, Keratin, type I cytoskeletal 12, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT12Q99456 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KRT12Q99456 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KRT12Q99456 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT12Q99456 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT12Q99456 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT12Q99456 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT12Q99456 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT12Q99456 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT12Q99456 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT12Q99456 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT12Q99456 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT12Q99456 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT12Q99456 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT12Q99456 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT12Q99456 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT12Q99456 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT12Q99456 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT12Q99456 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT12Q99456 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT12Q99456 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT12Q99456 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT12Q99456 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT12Q99456 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
KRT12Q99456 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
KRT12Q99456 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT12Q99456 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT12Q99456 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT12Q99456 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT12Q99456 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT12Q99456 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT12Q99456 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT12Q99456 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT12Q99456 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT12Q99456 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT12Q99456 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT12Q99456 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT12Q99456 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT12Q99456 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT12Q99456 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT12Q99456 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT12Q99456 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT12Q99456 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT12Q99456 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT12Q99456 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT12Q99456 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT12Q99456 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT12Q99456 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT12Q99456 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KRT12Q99456 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KRT12Q99456 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
KRT12Q99456 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
KRT12Q99456 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT12Q99456 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT12Q99456 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT12Q99456 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT12Q99456 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT12Q99456 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT12Q99456 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT12Q99456 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT12Q99456 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT12Q99456 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT12Q99456 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT12Q99456 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT12Q99456 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT12Q99456 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT12Q99456 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT12Q99456 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT12Q99456 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT12Q99456 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT12Q99456 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KRT12Q99456 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KRT12Q99456 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KRT12Q99456 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
KRT12Q99456 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
KRT12Q99456 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
KRT12Q99456 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT12Q99456 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT12Q99456 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT12Q99456 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT12Q99456 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT12Q99456 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT12Q99456 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT12Q99456 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT12Q99456 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT12Q99456 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT12Q99456 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT12Q99456 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT12Q99456 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT12Q99456 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT12Q99456 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT12Q99456 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT12Q99456 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT12Q99456 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT12Q99456 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT12Q99456 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT12Q99456 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT12Q99456 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT12Q99456 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT12Q99456 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT12Q99456 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms