Protein–RNA interactions for Protein: Q96T88

UHRF1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UHRF1Q96T88 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
UHRF1Q96T88 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
UHRF1Q96T88 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
UHRF1Q96T88 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
UHRF1Q96T88 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
UHRF1Q96T88 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
UHRF1Q96T88 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
UHRF1Q96T88 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
UHRF1Q96T88 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
UHRF1Q96T88 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
UHRF1Q96T88 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
UHRF1Q96T88 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
UHRF1Q96T88 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
UHRF1Q96T88 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
UHRF1Q96T88 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
UHRF1Q96T88 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
UHRF1Q96T88 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
UHRF1Q96T88 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
UHRF1Q96T88 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
UHRF1Q96T88 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
UHRF1Q96T88 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
UHRF1Q96T88 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
UHRF1Q96T88 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
UHRF1Q96T88 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
UHRF1Q96T88 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
UHRF1Q96T88 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
UHRF1Q96T88 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
UHRF1Q96T88 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
UHRF1Q96T88 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
UHRF1Q96T88 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
UHRF1Q96T88 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
UHRF1Q96T88 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
UHRF1Q96T88 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
UHRF1Q96T88 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
UHRF1Q96T88 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
UHRF1Q96T88 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
UHRF1Q96T88 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
UHRF1Q96T88 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
UHRF1Q96T88 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
UHRF1Q96T88 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
UHRF1Q96T88 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
UHRF1Q96T88 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
UHRF1Q96T88 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
UHRF1Q96T88 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
UHRF1Q96T88 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
UHRF1Q96T88 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
UHRF1Q96T88 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
UHRF1Q96T88 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
UHRF1Q96T88 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
UHRF1Q96T88 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
UHRF1Q96T88 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
UHRF1Q96T88 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
UHRF1Q96T88 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
UHRF1Q96T88 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
UHRF1Q96T88 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
UHRF1Q96T88 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
UHRF1Q96T88 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
UHRF1Q96T88 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
UHRF1Q96T88 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
UHRF1Q96T88 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
UHRF1Q96T88 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
UHRF1Q96T88 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
UHRF1Q96T88 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
UHRF1Q96T88 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
UHRF1Q96T88 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
UHRF1Q96T88 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
UHRF1Q96T88 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
UHRF1Q96T88 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
UHRF1Q96T88 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
UHRF1Q96T88 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
UHRF1Q96T88 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
UHRF1Q96T88 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
UHRF1Q96T88 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
UHRF1Q96T88 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
UHRF1Q96T88 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
UHRF1Q96T88 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
UHRF1Q96T88 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
UHRF1Q96T88 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
UHRF1Q96T88 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
UHRF1Q96T88 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
UHRF1Q96T88 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
UHRF1Q96T88 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
UHRF1Q96T88 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
UHRF1Q96T88 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
UHRF1Q96T88 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
UHRF1Q96T88 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
UHRF1Q96T88 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
UHRF1Q96T88 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
UHRF1Q96T88 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
UHRF1Q96T88 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
UHRF1Q96T88 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
UHRF1Q96T88 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
UHRF1Q96T88 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
UHRF1Q96T88 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
UHRF1Q96T88 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
UHRF1Q96T88 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
UHRF1Q96T88 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
UHRF1Q96T88 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
UHRF1Q96T88 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
UHRF1Q96T88 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms