Protein–RNA interactions for Protein: Q96T51

RUFY1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY1Q96T51 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RUFY1Q96T51 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RUFY1Q96T51 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RUFY1Q96T51 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RUFY1Q96T51 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RUFY1Q96T51 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RUFY1Q96T51 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RUFY1Q96T51 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RUFY1Q96T51 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RUFY1Q96T51 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RUFY1Q96T51 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RUFY1Q96T51 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RUFY1Q96T51 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RUFY1Q96T51 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RUFY1Q96T51 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
RUFY1Q96T51 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RUFY1Q96T51 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RUFY1Q96T51 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RUFY1Q96T51 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RUFY1Q96T51 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RUFY1Q96T51 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RUFY1Q96T51 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RUFY1Q96T51 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RUFY1Q96T51 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
RUFY1Q96T51 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RUFY1Q96T51 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RUFY1Q96T51 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RUFY1Q96T51 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RUFY1Q96T51 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RUFY1Q96T51 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RUFY1Q96T51 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RUFY1Q96T51 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RUFY1Q96T51 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RUFY1Q96T51 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RUFY1Q96T51 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RUFY1Q96T51 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RUFY1Q96T51 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RUFY1Q96T51 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RUFY1Q96T51 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
RUFY1Q96T51 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RUFY1Q96T51 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
RUFY1Q96T51 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RUFY1Q96T51 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
RUFY1Q96T51 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RUFY1Q96T51 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RUFY1Q96T51 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RUFY1Q96T51 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RUFY1Q96T51 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
RUFY1Q96T51 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
RUFY1Q96T51 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RUFY1Q96T51 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RUFY1Q96T51 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RUFY1Q96T51 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RUFY1Q96T51 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RUFY1Q96T51 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RUFY1Q96T51 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
RUFY1Q96T51 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RUFY1Q96T51 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RUFY1Q96T51 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RUFY1Q96T51 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RUFY1Q96T51 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RUFY1Q96T51 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RUFY1Q96T51 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RUFY1Q96T51 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
RUFY1Q96T51 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RUFY1Q96T51 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RUFY1Q96T51 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RUFY1Q96T51 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RUFY1Q96T51 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RUFY1Q96T51 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RUFY1Q96T51 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
RUFY1Q96T51 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RUFY1Q96T51 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RUFY1Q96T51 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RUFY1Q96T51 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RUFY1Q96T51 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RUFY1Q96T51 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RUFY1Q96T51 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RUFY1Q96T51 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RUFY1Q96T51 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RUFY1Q96T51 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RUFY1Q96T51 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RUFY1Q96T51 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RUFY1Q96T51 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RUFY1Q96T51 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RUFY1Q96T51 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RUFY1Q96T51 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RUFY1Q96T51 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RUFY1Q96T51 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RUFY1Q96T51 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RUFY1Q96T51 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RUFY1Q96T51 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RUFY1Q96T51 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RUFY1Q96T51 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RUFY1Q96T51 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RUFY1Q96T51 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RUFY1Q96T51 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RUFY1Q96T51 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RUFY1Q96T51 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RUFY1Q96T51 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms