Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q06

PLIN4, Perilipin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN4Q96Q06 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PLIN4Q96Q06 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PLIN4Q96Q06 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PLIN4Q96Q06 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
PLIN4Q96Q06 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PLIN4Q96Q06 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
PLIN4Q96Q06 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PLIN4Q96Q06 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PLIN4Q96Q06 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PLIN4Q96Q06 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PLIN4Q96Q06 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PLIN4Q96Q06 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PLIN4Q96Q06 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PLIN4Q96Q06 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PLIN4Q96Q06 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PLIN4Q96Q06 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PLIN4Q96Q06 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PLIN4Q96Q06 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PLIN4Q96Q06 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PLIN4Q96Q06 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PLIN4Q96Q06 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PLIN4Q96Q06 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PLIN4Q96Q06 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PLIN4Q96Q06 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PLIN4Q96Q06 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PLIN4Q96Q06 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PLIN4Q96Q06 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PLIN4Q96Q06 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PLIN4Q96Q06 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PLIN4Q96Q06 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
PLIN4Q96Q06 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PLIN4Q96Q06 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
PLIN4Q96Q06 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PLIN4Q96Q06 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PLIN4Q96Q06 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PLIN4Q96Q06 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PLIN4Q96Q06 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PLIN4Q96Q06 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PLIN4Q96Q06 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PLIN4Q96Q06 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PLIN4Q96Q06 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PLIN4Q96Q06 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PLIN4Q96Q06 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PLIN4Q96Q06 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PLIN4Q96Q06 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PLIN4Q96Q06 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PLIN4Q96Q06 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PLIN4Q96Q06 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PLIN4Q96Q06 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PLIN4Q96Q06 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PLIN4Q96Q06 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PLIN4Q96Q06 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PLIN4Q96Q06 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PLIN4Q96Q06 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PLIN4Q96Q06 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PLIN4Q96Q06 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PLIN4Q96Q06 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PLIN4Q96Q06 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
PLIN4Q96Q06 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PLIN4Q96Q06 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PLIN4Q96Q06 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PLIN4Q96Q06 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
PLIN4Q96Q06 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PLIN4Q96Q06 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PLIN4Q96Q06 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PLIN4Q96Q06 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PLIN4Q96Q06 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PLIN4Q96Q06 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PLIN4Q96Q06 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
PLIN4Q96Q06 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
PLIN4Q96Q06 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PLIN4Q96Q06 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PLIN4Q96Q06 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PLIN4Q96Q06 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PLIN4Q96Q06 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
PLIN4Q96Q06 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
PLIN4Q96Q06 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PLIN4Q96Q06 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PLIN4Q96Q06 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PLIN4Q96Q06 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PLIN4Q96Q06 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PLIN4Q96Q06 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PLIN4Q96Q06 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PLIN4Q96Q06 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PLIN4Q96Q06 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PLIN4Q96Q06 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PLIN4Q96Q06 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PLIN4Q96Q06 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PLIN4Q96Q06 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PLIN4Q96Q06 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PLIN4Q96Q06 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PLIN4Q96Q06 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PLIN4Q96Q06 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PLIN4Q96Q06 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PLIN4Q96Q06 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PLIN4Q96Q06 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PLIN4Q96Q06 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PLIN4Q96Q06 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PLIN4Q96Q06 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PLIN4Q96Q06 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms